印度稻曲病菌（Ustilaginoidea virens）的遗传多样性与种群结构研究：为稻曲病防控筑牢根基

为有效防控印度水稻稻曲病（Ustilaginoidea virens），研究人员对 34 株病菌进行研究，发现其遗传多样性高且分两个种群。

　　稻曲病（False smut）是由稻曲病菌（Ustilaginoidea virens）引起的，在印度，它正成为水稻的一种新病害。这种病害会降低水稻的产量和品质，给农民带来经济损失。为了制定有效的病害管理策略，了解病原菌的遗传多样性和种群结构至关重要。为此，研究人员从印度不同地区获取了 34 株稻曲病菌（U. virens）分离株，利用 25 个基因组特异性的简单序列重复标记（SSR 标记，Simple Sequence Repeat markers ）对其进行特征分析。这些标记具有较高的多态性信息含量（PIC，Polymorphic Information Content ），共产生了 203 个等位基因，每个标记平均产生 8.12 个。其遗传多样性在 0.00 到 0.885 之间，平均为 0.673。根据系统发育树，这 34 株稻曲病菌（U. virens）分离株被分为两个主要类群（类群 I 和类群 II）。类群 I 包括来自安得拉邦、比哈尔邦、喀拉拉邦、曼尼普尔邦、米佐拉姆邦、旁遮普邦和西孟加拉邦的分离株，而类群 II 包括来自阿萨姆邦、曼尼普尔邦、梅加拉亚邦和奥里萨邦的分离株。来自相同或邻近地区的分离株部分聚集在同一类群中。分子方差分析（AMOVA，Analysis of Molecular Variance ）显示，86% 的变异存在于个体之间，而种群之间的变异最少，仅为 14%。通过结构分析（STRUCTURE）和主坐标分析（PCoA，Principal Coordinates Analysis ）对 34 株稻曲病菌（U. virens）的种群结构进行评估，结果将这些分离株分为两个不同的亚种群。这些分离株的高遗传变异表明它们具有很强的进化和变异潜力，未来可能会对水稻作物造成损害。