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研究人员运用 DLS 技术研究 α- 突触核蛋白(Syn)聚集初期,确定其前体形式尺寸参数,为相关研究提供新方法。
探索 α- 突触核蛋白聚集的神秘之旅
在生命科学的微观世界里,蛋白质的聚集行为一直是科学家们关注的焦点。其中,α- 突触核蛋白(α-synuclein,Syn)的聚集与帕金森病的发生发展密切相关。然而,目前对于 Syn 在淀粉样形成初始阶段的特征,科学家们还知之甚少。尽管对其聚集机制展开了大量研究,但仍有诸多谜团未解开,比如 Syn 聚集到底是通过经典的成核生长聚合途径,还是蛋白质通过液 - 液相分离(LLPS)形成凝聚物的方式进行,尚无定论。而且,现有的研究方法在检测早期大的 Syn 聚集体时也存在不足,这就迫切需要新的研究来深入探索。
为了揭开这些谜团,来自里斯本大学高等技术学院结构化学中心、分子科学研究所,以及新里斯本大学安东尼奥?Xavier 化学与生物技术研究所的 Marco A. Saraiva 开展了一项重要研究。该研究成果发表在《European Biophysics Journal》上,为我们理解 Syn 的聚集过程带来了新的曙光。
研究的技术 “利器”
在这项研究中,研究人员主要运用了静态光散射(SLS)和动态光散射(DLS)两种关键技术。静态光散射用于探究早期大的 Syn 聚集体的形成机制,而动态光散射则用于研究 Syn 蛋白质在孵育初期 21 分钟内大聚集体的发展情况,通过分析其强度自相关函数来深入了解 Syn 的聚集过程。
研究结果大揭秘
- 确定早期大 Syn 聚集体的形成机制:研究人员通过静态光散射实验,对不同 pH 值(7、4、3、2)和不同蛋白质浓度的 Syn 溶液进行研究。结果发现,在 pH 4 时,蛋白质聚集明显增加;而在 pH 7、3、2 时,聚集较少。通过对 Rayleigh 散射强度数据的分析,研究人员推断,在 pH < 7 时,主要不存在 Syn 蛋白质凝聚物的形成,成核生长聚合途径更有可能是描述蛋白质溶液中 Syn 聚集过程的主要机制。
- 分析 DLS 自相关函数:研究人员在不同蛋白质浓度和 pH 值条件下进行 DLS 测量。结果显示,较低的蛋白质储备溶液浓度含有更多较大的蛋白质颗粒和更长的衰减时间。而且,在 pH 4.7 和 4.0 时,Syn 的聚集最高,这可能是由于蛋白质在这些 pH 值下发生了部分疏水塌陷,促进了聚集。同时,研究还发现,Syn 单体物种在初始 Syn 聚集体的形成中起主要作用。
- 模拟自相关函数确定聚集体尺寸:研究人员通过建立数学模型来模拟自相关函数,将拟合分布扩展到 105 μs,从而更准确地确定初始 Syn 聚集分子物种的真实大小。研究发现,溶液中较重的 Syn 颗粒的流体动力学直径表明存在一种细长的 Syn 物种,可能是 Syn 淀粉样前体形式。通过模拟还发现,这种细长的 Syn 淀粉样前体形式的长度与入射光波长(633nm)相近,利用 DLS 测量平移扩散 Dt和旋转扩散 Dr的衰减率,能够计算出其几何尺寸。
- 研究聚集体尺寸参数随 pH 的变化:研究人员进一步研究了 Syn 淀粉样前体形式的尺寸参数(长度、宽度和高度)随 pH 值的变化情况。结果发现,随着 pH 值从 7 降低到 5.5,再到 4.7 和 4.0,细长的 Syn 淀粉样前体形式的长度略有增加,然后在 pH 3 和 2 时下降。宽度的变化与计算出的 Rh变化模式相似,而高度则取决于蛋白质溶液的孵育时间,在 pH 4.7 和 4.0 时变化尤为明显。
研究的重要意义
这项研究具有重要的意义。它首次运用常规 DLS 技术在蛋白质溶液孵育初期(21 分钟内)分析了 Syn 聚集物种的存在情况,为研究 Syn 聚集的早期阶段提供了新的方法。通过确定 Syn 淀粉样前体形式的尺寸参数,研究人员能够更好地理解 Syn 聚集的机制,这对于深入研究帕金森病的发病机制具有重要的推动作用。此外,该研究还为开发针对帕金森病的治疗策略提供了潜在的靶点和理论依据,有望为未来的临床治疗带来新的突破。
总之,Marco A. Saraiva 的这项研究为我们打开了一扇了解 α- 突触核蛋白聚集早期阶段的窗户,让我们在探索帕金森病等相关疾病的道路上又迈出了坚实的一步。相信在未来,随着研究的不断深入,我们将能够更好地理解这些复杂的生物学过程,为人类健康事业做出更大的贡献。