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研究人员利用 Omics 技术研究植物对砷(As)胁迫的响应,为培育耐 As 作物和环境修复提供依据。
在环境问题日益严峻的当下,有毒金属污染成为了生态系统的一大威胁。其中,砷(As)作为一种对植物有害的非必需类金属,广泛存在于土壤、空气和水中,严重影响土壤生产力和环境健康,还通过食物链威胁人类健康。As 在环境中以多种形态存在,不同形态的 As 对植物的毒性和植物的吸收方式各异,其毒性作用机制复杂,涉及干扰植物的多种代谢过程,激活多种信号通路,引发氧化应激等问题。虽然此前已有研究探讨 As 毒性和耐受性的分子机制,但缺乏对植物暴露于 As 后分子变化的全面综述。
在此背景下,来自意大利莫利塞大学(University of Molise)等机构的研究人员开展了相关研究,旨在通过 Omics(组学)技术全面深入地了解植物对 As 胁迫的响应机制。该研究成果发表在《Planta》杂志上,为后续研究和实际应用提供了重要参考。
研究人员主要运用了基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等关键技术。在基因组学方面,采用定量性状位点(QTL)映射、全基因组关联研究(GWAS)等技术;转录组学中,运用微阵列和 RNA 测序(RNA-Seq)等方法;蛋白质组学则借助二维电泳 - 质谱(2-DE-MS)、液相色谱 - 质谱(LC-MS/MS)等手段;代谢组学使用液相色谱 - 质谱(LC-MS)、气相色谱 - 质谱(GC-MS)等技术,从不同层面分析植物对 As 胁迫的响应。
在基因组学研究中,QTL 映射技术被广泛应用于定位与植物 As 积累和耐受性相关的基因组区域。例如,在玉米研究中,通过该技术发现了多个与 As 浓度相关的 QTL,涉及不同组织部位,且部分标记在多个组织中均有出现,表明这些基因组区域在调控 As 浓度方面具有一定的一致性。在水稻研究中,也成功鉴定出与 As 耐受性和有机砷积累相关的 QTL。然而,QTL 映射存在分辨率低、耗时长等局限性。GWAS 则在一定程度上克服了这些问题,能够更精准地关联遗传变异与植物对 As 的响应,但它也存在依赖已知群体等不足。此外,随机扩增多态性 DNA(RAPD)和 PCR 选择抑制消减杂交(SSH)技术分别用于检测 As 诱导的基因组 DNA 损伤和鉴定差异表达基因,为研究植物对 As 胁迫的遗传响应提供了补充信息。
转录组学研究通过微阵列和 RNA-Seq 技术,揭示了植物在 As 胁迫下的基因表达变化。研究发现,As 胁迫会导致植物体内与氧化损伤、解毒、转运等相关的基因表达发生改变。例如,在拟南芥和印度芥菜的研究中,发现了多个受 As 胁迫调控的基因,这些基因参与了氧化应激反应、解毒途径以及激素信号传导等过程。同时,研究还发现不同品种植物对 As 胁迫的基因表达模式存在差异,一些基因在敏感品种和耐受品种中的表达变化不同,这为理解植物的 As 耐受性机制提供了重要线索。此外,转录组学研究还揭示了硫代谢在植物 As 耐受性中的重要作用,As 胁迫会诱导植物体内硫代谢相关基因的表达,影响 As 的吸收和分布。
蛋白质组学研究利用 2-DE-MS 和 LC-MS/MS 等技术,鉴定出了许多在 As 胁迫下表达发生变化的蛋白质。这些蛋白质参与了植物的能量代谢、光合作用、氧化应激响应等多个过程。例如,在水稻研究中,发现 As 胁迫会导致一些与能量代谢相关的蛋白质表达上调,而与光合作用相关的蛋白质表达下调,这表明 As 胁迫对植物的能量代谢和光合作用产生了显著影响。此外,通过蛋白质组学研究还发现,一些抗氧化酶和应激响应蛋白在植物应对 As 胁迫过程中发挥了重要作用,它们能够帮助植物减轻 As 诱导的氧化损伤,增强植物的耐受性。
代谢组学研究借助 LC-MS、GC-MS 等技术,全面分析了植物在 As 胁迫下的代谢物变化。研究发现,As 胁迫会导致植物体内多种代谢物的含量发生改变,涉及氨基酸、脂质、黄酮类等多个代谢途径。例如,在水稻研究中,发现 As 胁迫会影响甘油磷脂和氨基酸相关途径的代谢物含量,这些变化可能与植物的解毒过程和对 As 胁迫的适应有关。此外,代谢组学研究还发现,不同植物品种在 As 胁迫下的代谢物变化存在差异,这为筛选具有高 As 耐受性的植物品种提供了潜在的生物标志物。
综合上述研究结果,Omics 技术从多个层面揭示了植物对 As 胁迫的复杂响应机制。基因组学确定了与 As 积累和耐受相关的关键遗传区域;转录组学展示了基因表达的动态变化,明确了相关转录因子和信号通路;蛋白质组学鉴定出在 As 代谢、氧化应激响应等过程中起关键作用的蛋白质;代谢组学呈现了代谢物的变化,找到了与 As 胁迫相关的重要代谢途径。
这些研究成果对于培育耐 As 作物品种、提高植物修复效率具有重要意义。通过精准育种或基因组编辑技术,有望将耐 As 相关基因导入作物中,增强作物对 As 胁迫的耐受性,保障粮食安全。同时,利用蛋白质组学和代谢组学鉴定出的生物标志物和关键代谢途径,可优化植物修复策略,提高对 As 污染土壤的修复效果。未来,随着 Omics 技术的不断发展,多组学整合将为深入理解植物与 As 的相互作用提供更全面的视角,为解决 As 污染问题提供更有效的方案。