果蝇Drosophila melanogaster组织和器官特异性蛋白质组、磷酸化蛋白质组及激酶组图谱构建及其意义

为构建果蝇（D. melanogaster）相关图谱，研究人员开展研究，明确多种蛋白等信息，助力系统分析。

　　果蝇（Drosophila melanogaster）是一种广泛应用于生物医学研究的简单多细胞模式生物。在此研究中，研究人员旨在构建一个全面的果蝇组织和器官特异性蛋白质组、磷酸化蛋白质组以及激酶组图谱。研究人员利用已发表文献和数据库中的信息，系统整理了果蝇在不同发育阶段、成熟个体及其衍生细胞系中 11 种组织类型的蛋白质表达谱、磷酸化模式，以及相关的激酶和磷酸酶。使用 DAVID 进行基因注释和通路富集分析，利用 STRING、BioGrid、OmniPath 和 InWeb-IM 进行蛋白质 - 蛋白质相互作用分析。通过 FlyBase 数据库和 DRSC 综合直系同源预测工具，鉴定出果蝇激酶和磷酸酶基因在人类和小鼠中的直系同源基因。研究人员在果蝇中共绘制出 18,377 种蛋白质、9,021 种磷酸化蛋白质、433 种激酶和 141 种磷酸酶。随后，将这些蛋白质按不同组织类型分类，结果显示存在一些组织特异性通路和表达簇的富集现象。通过直系同源筛选，研究人员在人类和小鼠中分别鉴定出 295 种和 289 种果蝇激酶的直系同源基因。在节律性分析中，研究人员观察到 5289 种转录本、678 种蛋白质、437 种磷酸化蛋白质、166 种激酶和 89 种磷酸酶存在 24 小时的周期性变化。该研究结果整合成为一个便捷的资源，有助于理解果蝇蛋白质组水平的组织架构、振荡表达，以及它们在维持细胞和生理功能中的组织特异性作用。研究人员预计，这项研究将有助于加强对果蝇作为模式生物的系统水平分析。