综述:探秘 β -1,2 - 葡聚糖环化酶:解锁生物分子奥秘的新钥匙

【字体: 时间:2025年03月06日 来源:Applied Microbiology and Biotechnology 3.9

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  研究人员针对 β -1,2 - 葡聚糖相关酶研究不足问题,探究其环化酶,揭示新机制与酶家族,助力相关应用。

  在微观的生物世界里,糖类物质扮演着极为重要的角色。它们可不只是为生物提供能量,还参与构建细胞骨架、储存能量,甚至在生物间的感染、免疫反应等相互作用中发挥关键作用。β -1,2 - 葡聚糖(β -1,2-glucans)便是其中一类独特的多糖,尽管它在自然界中含量稀少,却广泛分布于多种生物体内,这暗示着它具有重要的生理功能。
β -1,2 - 葡聚糖有着多种 “形态”。环状 β -1,2 - 葡聚糖(Cyclic β -1,2-glucan,CβG)最早被发现,在革兰氏阴性菌和可食用绿藻中都能找到它的身影,它不仅是共生或致病的关键因素,还参与渗透压调节和铁储存。α -1,6 - 环化 β -1,2 - 葡聚糖(α -1,6-Cyclized β -1,2-glucan,CβGα)同样存在于多种细菌中,在植物病原菌的致病过程中意义重大。线性 β -1,2 - 葡聚糖(Linear β -1,2-glucan,LβG)如大肠杆菌中的渗透压调节周质葡聚糖(Osmoregulated periplasmic glucans,OPGs),对微生物的生存也至关重要,影响着抗生素抗性、细胞形态调节等生理过程。此外,还有 β -1,2 - 葡寡糖(β -1,2-Glucooligosaccharides,SopnS)和 β -1,2 - 寡糖苷(β -1,2-Oligoglucosides),它们也各自在生物体内发挥着独特作用。

然而,长期以来,β -1,2 - 葡聚糖相关的研究面临诸多难题。由于其在自然界的稀缺性,相关酶的探索进展缓慢。尤其是线性 β -1,2 - 葡聚糖环化的机制以及负责环化的酶,一直是未解之谜。为了攻克这些难题,来自东京理科大学(Tokyo University of Science)的 Masahiro Nakajima、Sei Motouchi 等研究人员展开了深入研究,相关成果发表在《Applied Microbiology and Biotechnology 》上。

研究人员在探索 β -1,2 - 葡聚糖相关酶的过程中,采用了多种关键技术方法。通过基因克隆技术,从不同细菌中获取编码相关酶的基因,为后续研究奠定基础。利用蛋白质纯化技术,获得高纯度的目标酶,以便进行结构和功能分析。借助质谱(ESI - MS)和核磁共振(NMR)等分析技术,精确鉴定酶促反应产物的结构和组成,从而深入了解酶的作用机制。

在 β -1,2 - 葡聚糖降解酶研究方面,研究人员取得了重要突破。2014 年发现的 1,2-β - 寡葡聚糖磷酸化酶(1,2-β -Oligoglucan phosphorylase,SOGP),可催化 β -1,2 - 葡寡糖的磷酸解反应,利用其逆反应成功开发出大规模生产 LβG 的方法。此后,以合成的 LβG 为碳源,在不同微生物中筛选并鉴定出 β -1,2 - 葡聚糖酶(β -1,2-Glucanase,SGL)基因,这些新发现的酶被归类到新的糖苷水解酶家族(Glycoside hydrolases,GH),即 GH144 和 GH162。随着研究的深入,更多与 β -1,2 - 葡聚糖相关的酶被发现,极大地扩充了该领域的酶库。

在 β -1,2 - 葡聚糖相关碳水化合物合成酶研究中,对环状 β -1,2 - 葡聚糖合酶(Cyclic β -1,2-glucan synthase,CGS)的研究最为深入。CGS 是一种大型膜蛋白,由多个区域组成,其催化过程包括起始、延伸、调整和环化四个步骤。研究人员对来自不同细菌的 CGS 进行研究,其中对来自 Thermoanaerobacter italicus 的 CGS(TiCGS)的研究尤为关键。通过对 TiCGS 中保守结构域(TiCGSTg)的研究发现,它能特异性地作用于 LβG,催化生成 CβG,且遵循异头物保留机制。通过定点突变实验,确定了其催化过程中的关键氨基酸残基,如 E1442 作为亲核试剂、E1356 作为酸碱催化剂,揭示了其独特的催化机制。此外,对 R. radiobacter 的 CGS(RrCGS)的研究,借助冷冻电镜技术解析了其整体结构,进一步加深了对 CGS 催化过程的理解。

对于 CβGα 合成酶的研究,研究人员发现参与 OPG 合成的 OpgG 和 OpgD 属于新的 GH186 家族。其中,X. campestris 中的 XccOpgD 能特异性地将 LβG 转化为 CβGα,通过对其反应机制的研究,首次从三级结构层面揭示了其催化过程中的异头物翻转转糖基化机制。

这项研究意义重大。在基础研究方面,揭示了 β -1,2 - 葡聚糖环化酶的结构与功能,为深入理解 β -1,2 - 葡聚糖在生物体内的代谢过程和生理功能提供了理论依据。在应用研究方面,新发现的酶和反应机制为开发新型农药、设计具有特定功能的酶提供了新的思路和平台,有望在农业、医药等领域发挥重要作用。同时,研究也为进一步挖掘自然界中未知的酶和生物分子机制指明了方向,激励更多科研人员投身于相关领域的探索。

研究人员通过对 β -1,2 - 葡聚糖环化酶的深入研究,揭示了一系列新的酶和反应机制,为生命科学领域带来了新的认知和突破。然而,目前对于 β -1,2 - 葡聚糖相关酶的研究仍处于初级阶段,未来还需要更多的研究来深入探索这些酶的多样性、功能以及在不同生物过程中的作用,为实现其广泛的应用奠定基础。
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