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为探究 piRNAs 和 circRNAs 对肾透明细胞癌(ccRCC)的诊断价值,研究发现二者组合检测 AUC 可达 0.878,意义重大。
肾透明细胞癌(ccRCC)是泌尿系统中较为常见的恶性肿瘤,然而它就像一个 “隐匿的杀手”,常常在悄无声息中发展,很多患者确诊时病情已到晚期。目前,计算机断层扫描(CT)虽为诊断肾细胞癌(RCC)的主要方式,但仍有大约 30% 的患者在初次诊断时就已出现远处转移,错过最佳治疗时机,预后情况不容乐观。因此,寻找更有效的诊断策略迫在眉睫。
为了攻克这一难题,暨南大学附属第一医院等机构的研究人员开展了一项关于 piRNAs 和 circRNAs 在 ccRCC 中作用的研究,相关成果发表在《Scientific Reports》上。
研究人员主要运用了以下几种关键技术方法:一是收集临床样本,从暨南大学附属第一医院 2014 - 2018 年接受手术切除肿瘤的患者处获取临床组织样本,并经病理确诊;二是高通量测序,分析 piRNAs 和 circRNAs 的测序数据;三是 RT - qPCR,检测临床样本中相关 RNA 的表达水平;四是统计分析,运用专业软件分析数据差异,评估诊断性能。
研究结果如下:
- piRNAs 的特征:通过对 ccRCC 和相邻正常肾组织进行小 RNA 测序,发现 piRNAs 在染色体上分布不均匀,且来源于重复序列区域的 piRNAs 读长计数超过基因区域。在差异表达分析中,鉴定出 22 种显著差异表达的 piRNAs,其中 17 种在 ccRCC 组织中上调,5 种下调。对 piRNA 簇的分析也发现了 3 个差异表达的簇。经 RT - qPCR 验证,piR - hsa - 150997、133872、132556、154502 和 uniq - 84737 在 ccRCC 样本中表达显著下调123。
- circRNAs 的特征:研究检测到所有样本库中均存在 circRNAs,经筛选发现 694 种 circRNAs 在 ccRCC 组织中显著下调,490 种上调。挑选部分 circRNAs 进行展示,RT - qPCR 验证显示 circABCC1 和 circNETO2_006 在相邻组织组中表达上调,circARID1B_037 表达下调45。
- piRNAs 和 circRNAs 作为诊断指标的功能:通过计算受试者工作特征曲线(ROC)下面积(AUC)评估诊断性能,piR - hsa - 150997、133872 等 piRNAs 以及 circABCC1、circNETO2_006 等 circRNAs 单独诊断 ccRCC 时,AUC 有一定数值。将多种 piRNAs 和 circRNAs 整合构建复合诊断模型后,诊断性能显著提升,如包含 piR - hsa - 150997、piR - hsa - 133872 等的模型 AUC 可达 0.878,包含 piR - hsa - 150997、uniq_84737 等的模型 AUC 为 0.872,这些模型有望成为 ccRCC 患者卓越的临床诊断标志物67。
研究结论与讨论部分指出,该研究明确了 piRNAs 和 circRNAs 在 ccRCC 中的异常表达情况,且二者联合检测对 ccRCC 具有较高的诊断价值,为癌症研究和新型治疗靶点开发提供了重要依据。不过,研究也存在一定局限性,样本数量有限,且未对尿液、外泌体和血清中这些生物标志物的表达差异进行研究。未来还需扩大样本规模,深入探究这些非编码 RNA 的功能和作为治疗靶点的潜力,以实现更有效的临床治疗。总之,这项研究为 ccRCC 的诊断和治疗开辟了新方向,有望在未来为患者带来更多希望。