“电化学叶” 技术:拓展蛋白质膜电化学研究非氧化还原酶及金属离子反应

【字体: 时间:2025年03月06日 来源:JBIC Journal of Biological Inorganic Chemistry 2.7

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  研究人员利用 “电化学叶”(e-Leaf)拓展蛋白质膜电化学(PFE),研究非氧化还原酶和金属离子反应,成果意义重大。

  在生命的微观世界里,酶就像一群勤劳的 “小工匠”,它们参与着生物体几乎所有的化学反应,维持着生命的正常运转。而金属离子,对于许多酶来说,就像是它们手中不可或缺的 “工具”,直接或间接影响着酶的活性。在生物无机化学领域,研究酶与金属离子的关系一直是个热门话题。然而,传统研究方法存在不少难题。比如,那些不参与电子转移、也不催化氧化还原反应的酶,还有光谱检测受限、不稳定的金属离子,想要深入研究它们的反应,简直困难重重。而且,以往研究大多只能针对特定类型的酶,研究范围很窄,难以全面了解酶与金属离子之间复杂的相互作用。为了攻克这些难题,来自英国曼彻斯特大学、美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校和英国牛津大学的研究人员,开展了一项极具创新性的研究,相关成果发表在《JBIC Journal of Biological Inorganic Chemistry》上。
研究人员利用 “电化学叶”(e-Leaf)这一新兴技术,对蛋白质膜电化学(PFE)进行了拓展。PFE 原本主要用于研究电子转移蛋白和酶,但在面对众多非氧化还原酶和难以检测的金属离子时却束手无策。而 e-Leaf 就像是给 PFE 装上了 “超级翅膀”,让它能够突破局限,飞向更广阔的研究领域。
研究人员用到的主要关键技术方法包括:首先是构建 e-Leaf 装置,通过电泳在合适电极上沉积氧化铟锡纳米颗粒,形成具有特定孔径的多孔材料,用于固定酶;其次是运用循环伏安法和计时电流法,这两种电化学方法能分别展示电流随电极电位和时间的变化,从而获取酶反应的热力学和动力学信息。
下面来看看具体的研究结果:
  • 脱氢酶的研究(Zn2+和 Mg2+依赖型):研究人员以 NAD (P) 依赖的醇脱氢酶(ADH)为例进行研究。不同结构和底物选择性的 ADH 被加载到电极孔中,通过改变 pH 或底物浓度比,能操控其热力学催化偏向。比如,来自嗜热厌氧乙醇杆菌的 ZnADH 是四聚体,每个单体含一个紧密结合的催化 Zn2+,对 S - 对映体有选择性;而来自开菲尔乳杆菌的 ADH 不依赖 Zn2+,依赖两个不稳定的 Mg2+来维持活性构象,对 R - 对映体有选择性。利用这两种酶的差异,研究人员设计了用于仲醇的消旋化 / 立体反转体系。另外,对于异柠檬酸脱氢酶(IDH),它是 Mg2+依赖的酶,催化异柠檬酸氧化脱羧生成 2 - 氧代戊二酸(2OG)。2OG 是重要代谢物,IDH 突变与多种癌症相关。研究人员通过 e-Leaf 研究了 IDH1 的野生型和突变型(如 R132H),发现 R132H 突变体几乎失去异柠檬酸氧化活性,转而催化 2OG 还原为 2 - 羟基戊二酸(2HG),且对 Mg2+结合亲和力大幅降低。通过监测药物 ivosidenib 对突变体的抑制作用,研究人员详细了解了其抑制动力学。
  • 激酶的研究:进一步拓展远离电子转移的研究:将激酶整合到 e-Leaf 中,为研究开辟了新方向。以羧酸还原酶(CAR)为例,它能利用 NADPH 和 ATP 将羧酸还原为醛,其中 ATP 是 Mg2+的复合物。通过 CAR,e-Leaf 电极中的电催化电流可追踪共加载激酶的作用。研究发现,激酶对 ATP 的高效积累和循环,比直接添加 ATP 作为反应物更有效,且整个电催化速率对腺苷酸激酶(AK)更敏感。
在研究结论和讨论部分,e-Leaf 技术展现出诸多优势。它操作简便,不仅能快速筛选与复杂酶系统相互作用的物质,还能在高酶浓度稳态条件下,获取亲和力和动力学的定量数据,这是传统酶研究难以做到的。而且,电化学方法控制和测量酶活性的能力,通过 e-Leaf 成功拓展到非氧化还原酶领域。虽然目前合成环境与酶的自然环境存在差异,但 e-Leaf 中蛋白质分子的高浓度状态更接近活细胞内环境,这为研究提供了新的思路。此外,e-Leaf 还可能为光谱学研究带来新机遇,有望让我们更深入地探索酶与金属离子的奥秘,为生物无机化学和相关医学领域的发展提供有力支持。
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