肠道芽孢杆菌 Bacillus velezensisHF-14,109的基因组解析：开启水产养殖益生菌新篇

研究人员对 Bacillus velezensisHF-14,109基因组测序分析，发现其可水解多糖、抑制病菌，有望成水产益生菌。

　　贝莱斯芽孢杆菌（Bacillus velezensis，B. velezensis）HF-14,109 是从健康鲤鱼（Cyprinus carpio L.）肠道中分离出的一种好氧革兰氏阳性菌。在此，研究人员对 HF-14,109 的基因组进行了测序和注释，识别并分类了其产酶基因和次生代谢物生物合成基因簇（BGCs），还在体外验证了其对病原菌的抑制作用。结果显示，HF-14,109 拥有一个 4,214,172 bp 的环状基因组，包含 4,392 个预测基因，平均长度为 851.56 bp，GC 含量为 46.94%。预测还发现共有 210 个非编码 RNA、8 个 CRISPR 序列和 152 个串联重复序列。基于碳水化合物活性酶（CAZy）数据库分析，HF-14,109 含有 93 个编码参与碳水化合物相关过程的酶的基因，其中 38 个是糖苷水解酶基因，且可分为 20 个家族。根据酶的预测结果，HF-14,109 有能力水解淀粉等高分子碳水化合物、乳糖和蔗糖等二糖，以及 β- 葡聚糖、甘露聚糖、果聚糖和木聚糖等非淀粉多糖。通过 antiSMASH 分析，识别出 12 个用于产生次生代谢物的 BGCs，其中 5 个预计编码聚酮合酶（PKSs）和非核糖体肽合成酶（NRPSs），这表明 HF-14,109 能够产生多种次生代谢物。HF-14,109 的基因组包含众多编码糖苷水解酶的基因和用于产生次生代谢物的 BGCs。此外，HF-14,109 在体外能够抑制迟缓爱德华氏菌（E. tarda）、嗜水气单胞菌（A. hydrophila）、金黄色葡萄球菌（S. aurenus）和大肠杆菌（E. coli）等病原菌。总之，研究结果表明，HF-14,109 具有水解非淀粉多糖和抑制病原菌的作用，这为阐明其抗菌和产酶机制奠定了坚实基础，并且有望在未来开发成为水产养殖饲料的益生菌。