亚马逊鱼肠道贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)的基因组解析:探索益生菌及促植物生长潜力
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时间:2025年03月06日
来源:Molecular Genetics and Genomics 2.3
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为探究贝莱斯芽孢杆菌(B. velezensis)作为益生菌和促植物生长(PGP)潜力,研究人员开展基因组比较研究,发现诸多特性,助力其生物技术开发。
不断有具有显著抗菌活性的新型贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)菌株被报道。研究人员通过泛基因组方法,对从亚马逊鱼类肠道中分离出的 5 株贝莱斯芽孢杆菌菌株与 RefSeq 数据库中的其他 266 个基因组进行了基因组比较。旨在分析该进化枝内各菌株的共性和特性,探索其作为益生菌和促进植物生长(PGP)的潜力。获得了菌株 P7 和 P11 的高质量基因组草图序列,基因组指标证实它们属于贝莱斯芽孢杆菌。对 271 个贝莱斯芽孢杆菌基因组序列的评估显示,其泛基因组由 14,918 个同源物组成,其中 16% 为核心基因组。因此,大多数基因属于辅助可变基因组,许多菌株含有大量独特基因,包括亚马逊菌株 P45。该菌株在产生多种水解酶和具备促植物生长特性方面也表现突出。对所有 5 株亚马逊菌株的基因组挖掘注释出了尚未确定的次生代谢产物。评估的益生菌基因在所有贝莱斯芽孢杆菌菌株中大多是保守的。此外,对可移动基因组、抗性基因组和毒力因子的研究表明,这些菌株可被视为用于益生菌和农业应用的安全菌株,这与之前的研究结果相符。这些数据将有助于增进对这些菌株及其他贝莱斯芽孢杆菌的理解和生物技术开发。
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