综述:细胞命运变化追踪:研究历史、进展、挑战与展望

【字体: 时间:2025年03月06日 来源:Science China Life Sciences 8

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  细胞命运变化对生命进程意义重大,研究人员梳理细胞谱系追踪研究,探讨挑战与前景。

  细胞命运变化在自然发育、疾病进展以及治疗干预效果等过程中发挥着至关重要的作用。对细胞扩张、分化、转分化、去分化、重编程和状态转变等各类细胞命运变化的定义,属于一个复杂且不断发展的研究领域,即细胞谱系追踪(cell lineage tracing)。这篇综述将系统地介绍该领域的研究历史和进展,大致可分为前瞻性追踪(prospective tracing)和回顾性追踪(retrospective tracing)两部分。第一部分涵盖了一系列方法,包括同位素标记、瞬时荧光示踪剂、非荧光瞬时示踪剂、非荧光遗传标记、荧光蛋白、遗传标记传递、基因重组、外源 DNA 条形码(exogenous DNA barcodes)、CRISPR-Cas9 介导的 DNA 条形码(CRISPR-Cas9 mediated DNA barcodes)以及碱基编辑器介导的 DNA 条形码(base editor-mediated DNA barcodes)。综述的第二部分讨论了遗传镶嵌现象、基因组 DNA 改变、T 细胞受体 / B 细胞受体(TCR/BCR)、DNA 甲基化和线粒体 DNA 突变。在最后一部分,文章将探讨细胞谱系追踪领域的主要挑战和未来的研究方向,特别关注与单细胞遗传谱系追踪(single-cell genetic lineage tracing)相关的测序技术和数学模型,以及在细胞谱系追踪研究中在时空层面进行更全面研究的价值。
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