鼻咽癌干性相关研究:揭示关键 miRNA,开拓治疗新方向
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时间:2025年03月08日
来源:Functional & Integrative Genomics 3.9
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为解决鼻咽癌(NPC)复发、转移和耐药问题,研究人员开展相关研究,发现关键 miRNA,或改善治疗效果。
鼻咽癌(NPC)的复发、远处转移以及耐药性仍是临床预后的重大阻碍。癌症干性被认为是关键因素,但直接证据较少。研究人员利用生物信息学和机器学习技术,对单细胞 RNA 测序(single-cell RNA-seq)和大量转录组数据集进行分析,并辅以基础实验,以探究鼻咽癌基于干性的特征。分析识别出鼻咽癌细胞两种潜在的发育轨迹,每种轨迹表现出不同程度的干性。随后,研究人员识别并验证了一种癌症干性相关特征(STEM-signature)。单细胞分析显示,干性高的鼻咽癌患者中,LAYN?CD8?、CTLA4?CD4?、CXCL13?CD4?T 细胞、肿瘤相关巨噬细胞和 CD14?单核细胞富集。NicheNet 分析表明,这些免疫细胞调节癌症干性。大量转录组分析证实了这些发现,表明干性高的鼻咽癌治疗反应较差。研究人员预测出 13 种潜在药物,并识别出 13 种与高干性鼻咽癌相关的干性 miRNA。基于这种 miRNA 特征构建的最小绝对收缩和选择算子(LASSO)Cox 回归模型,在验证集和测试集中预测总生存期的曲线下面积(AUC)分别为 0.71 和 0.72 。基于 miRNA 的干性特征优于先前建立的特征。多变量 Cox 回归分析表明,该预后特征可作为独立的预后因素(p<0.001)。基础实验显示,miR-300、miR-361-5p、miR-1246 和 miR-1290 增强了鼻咽癌细胞的干性特征,促进了细胞增殖、侵袭和迁移。这些发现表明,这四种与干性相关的 miRNA 可作为治疗靶点,有望通过靶向干性相关基因改善治疗反应。
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