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为探究印度北部家猪 mtDNA 谱系分布与变异,研究人员测序分析,发现多样母系谱系等成果,助力理解进化史。
研究旨在探索印度北部家猪线粒体 DNA(mtDNA)谱系的分布与变异情况,在以往局部研究的基础上,将其置于更广阔的全球背景下展开分析。研究人员对来自北阿坎德邦(Uttarakhand)和贾坎德邦(Jharkhand)的 82 份家猪样本的 mtDNA 控制区(417bp)进行了测序,并与全球各地区已公布的 1517 份野猪(Sus scrofa)序列进行对比。此前该研究团队在局部范围内分析过的北阿坎德邦序列,也被纳入此次研究,以便进行更广泛的全球比较分析。
分析结果显示,存在 18 种单倍型(haplotype),它们呈现出复杂的聚类模式,并且带有明显的系统地理信号,这反映出印度这两个邦的家猪种群中有着多样的母系谱系。研究还识别出两种不同的野猪亚种(W1 和 W2),为它们在印度的分布提供了有力的系统地理证据。此外,研究人员检测到一个新的类群(MC-I),它主要集中在乔塔纳格普尔高原(Chotanagpur plateau),这为研究其与 D5 类群的联系提供了新视角。值得注意的是,研究发现喜马拉雅山麓存在一个独立驯化中心的证据,北阿坎德邦的大多数样本都位于 D3 类群,这表明该驯化中心与古代人类迁徙以及随后猪在该地区的扩散存在关联。北阿坎德邦多样的母系谱系可能与古代人类迁徙有关,这意味着该地区猪的扩散可能是由人类介导的。这些研究结果有助于深入理解野猪(Sus scrofa)的进化历史和全球迁移模式,突出了印度次大陆猪的遗传独特性,以及在更广泛的猪遗传资源研究中的重要意义。