首次解析细弱软骨藻线粒体基因组:为红藻研究开辟新路径

【字体: 时间:2025年03月08日 来源:Biochemical Genetics 2.1

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  研究人员首次对细弱软骨藻(Chondracanthus tenellus)进行线粒体基因组测序,明确其分类地位,助力后续研究。

  红藻在保健食品领域,常被视作具有促进健康的生物活性化合物和膳食纤维的重要来源。然而,由于红藻的藻体形态相似,且具有高度的可塑性,再加上仅有少数物种的线粒体基因组(mitochondrial genome)被完整报道,基于形态学和分子特征对红藻物种进行准确的识别和分类,一直是个颇具挑战性的难题。在这项研究中,科研人员首次对大型红藻细弱软骨藻(Chondracanthus tenellus (Harvey) (Hommersand et al., Hydrobiologia 260:105–120, 1993))(红藻门,杉藻目)的线粒体基因组进行了完整测序。此外,研究人员还试图利用完整的线粒体基因组序列,重建杉藻目物种之间的系统发育关系。
研究过程中,科研人员先提取了细弱软骨藻的基因组 DNA,通过全基因组测序(WGS)进行分析,再利用 NOVOPlasty 软件进行序列组装。之后,对线粒体基因组序列进行注释,并通过最大似然分析构建基因组图谱和系统发育树。

研究结果显示,细弱软骨藻的线粒体基因组长度为 25,928bp,AT 含量(72.08%)明显偏高,包含 3 种 rRNA、23 种 tRNA 和 24 种蛋白质编码基因(PCGs)。与其他红藻的线粒体基因组相比,细弱软骨藻的线粒体基因组缺少 rpl5 和 rpl20 基因。基于完整线粒体基因组的系统发育研究表明,细弱软骨藻属于杉藻科,并且与杉藻目其他物种构成单系类群。

这是首次关于细弱软骨藻完整线粒体基因组的报道,其特征与其他红藻相符。该基因组数据的研究成果,将为未来的比较基因组学、系统发育学以及进化研究提供有力支持。
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