探秘牦牛肌内脂肪沉积调控密码：lncRNAs 的关键作用

为探究调控牦牛肌内脂肪（IMF）沉积的 lncRNAs，研究人员开展相关研究，发现关键分子及通路，意义重大。

　　肌内脂肪（Intramuscular Fat，IMF）含量是牦牛肉品质的关键指标。本研究旨在鉴定调控牦牛 IMF 沉积的长链非编码 RNA（lncRNAs）。研究选用了 3 头 3 月龄雄性犊牛牦牛和 3 头 3 岁雄性成年牦牛。屠宰后，运用冷冻切片技术评估背最长肌（Longissimus Dorsi，LD）的组织形态，并利用 RNA 测序（RNA-Seq）技术鉴定差异表达的 lncRNAs 和信使核糖核酸（mRNAs，DEls 和 DEMs）。结果显示，成年牦牛脂肪滴的直径和体积均显著大于犊牛（P＜0.001） 。研究共鉴定出 37,790 个基因和 16,400 个调控脂肪沉积的 lncRNAs。其中，犊牛和成年牦牛之间有 2327 个 mRNAs 和 474 个 lncRNAs 存在差异表达。筛选出差异表达基因（DEGs）硬脂酰辅酶 A 去饱和酶（stearoyl-CoA desaturase，SCD）、脂肪酸合酶（fatty acid synthase，FASN）、脂肪酸结合蛋白 4（fatty acid binding protein 4，FABP4）、纤连蛋白 1（fibronectin 1，FN1）以及差异表达 lncRNAs（DELs）MSTRG.15795.4 和 MSTRG.35028.6。对由 DEMs 和 DELs 调控的富集和通路进行预测，发现显著富集的与脂肪沉积相关的生物学过程和通路，包括不饱和脂肪酸的生物合成、脂肪酸生物合成、脂肪酸延长以及哺乳动物雷帕霉素靶蛋白（mTOR）信号通路。构建了 DELs 与相关基因的共表达网络，这些基因包括 MSTRG.10268.1 - 胎盘相关蛋白 8（placenta associated 8，PLAC8）、MSTRG.16223.1 - 半乳糖凝集素 3（galectin 3，LGALS3）、MSTRG.34732.1 - 线粒体甘油 - 3 - 磷酸酰基转移酶（glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial，GPAM）、MSTRG.11907.11 - 成纤维细胞生长因子 1（fibroblast growth factor 1，FGF1）、MSTRG.34342.1 - 溶酶体酸性脂肪酶 A（lipase A, lysosomal acid type，LIPA）以及 MSTRG.1667.2 - 整合素 β2 亚基（integrin subunit beta 2，ITGB2）。通过实时荧光定量聚合酶链式反应（RT-qPCR）验证了测序结果。该研究进一步探索了 lncRNAs 对牦牛肌内脂肪沉积的分子调控机制。