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为预测肺腺癌（LUAD）患者预后及免疫治疗效果，研究人员构建 13 基因的溶酶体相关预后特征（LRPS），可指导个性化治疗。
肺癌，这个 “癌症之王”，多年来一直稳居全球癌症发病率和死亡率榜首。其中，肺腺癌（LUAD）作为非小细胞肺癌中最常见的亚型，更是让无数患者陷入困境。由于肺癌早期症状隐匿，多数患者确诊时已处于晚期，即便接受手术治疗，术后复发风险也极高。近年来，免疫治疗和靶向治疗虽给肺癌患者带来了新希望，但耐药性增加、不良反应频发等问题，使得临床获益大打折扣，患者 5 年生存率依旧不足 15%，发生转移后的生存率更是低于 3%。因此，寻找能精准预测肺癌预后的生物标志物，进而指导个性化临床治疗，成为了医学领域亟待攻克的难题。
在此背景下，南京医科大学第一附属医院等机构的研究人员展开了深入研究。他们的研究成果发表在《Clinical Cancer Bulletin》上，为肺腺癌的诊疗带来了新曙光。
研究人员为开展此项研究，运用了多种关键技术方法。数据方面，从 TCGA 数据集下载 LUAD 相关 RNA 测序数据及临床病理数据，同时选取 GSE72094 和 GSE31210 队列作为独立验证集。通过 R 语言的相关程序包进行数据处理，如利用 “sva” 包的 ComBat 函数校正批次效应，使用 “ConsensuClusterPlus” 包进行共识聚类分析等。还运用单样本基因集富集分析（ssGSEA）、CIBERSORT 算法等评估免疫细胞浸润情况，借助这些技术全面分析数据。
下面来详细看看研究结果：
- 溶酶体相关基因的突变景观：通过构建蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）网络，发现 RAB7A、HPS4 等是关键基因。研究还发现，38.65% 的 LUAD 患者存在 35 个溶酶体相关基因（LRGs）突变，LRP2 突变发生率最高，且 61 个 LRGs 普遍存在拷贝数变异（CNVs）。
- 溶酶体相关亚群的鉴定：进行共识聚类分析，将患者分为 C1 和 C2 两个亚群。C2 亚群免疫细胞浸润程度高，免疫相关功能或通路更多。功能富集分析表明，溶酶体可能在 LUAD 发展中发挥重要作用。
- LRPS 的构建与验证：基于亚群差异表达基因（DEGs），经单因素和多因素 Cox 回归及 LASSO 分析，构建了包含 13 个基因的溶酶体相关预后特征（LRPS）。风险评分公式为：风险评分 = (0.0946925170797)×DKK1 + (0.070358709456)×RHOV + … + (0.065412341174)×ELOVL2。训练集和验证集结果显示，高风险组患者预后较差，LRPS 预测能力较强。
- LRPS 的临床相关性分析：LRPS 风险评分与患者性别、肿瘤分期相关，男性和晚期患者风险评分更高。分层生存分析和 Cox 回归表明，LRPS 是独立预后因素。
- 列线图的建立与验证：结合 LRPS 风险评分和临床特征构建列线图，校准曲线和 ROC 曲线显示其预测准确性良好，有助于临床管理。
- 单细胞测序分析：通过单细胞 RNA 测序，确定了 13 种细胞类型，发现肿瘤组织中 AT2 细胞、B 细胞和 T/NK 细胞含量较高。还明确了 13 个模型基因在不同细胞类型中的分布。
- 免疫景观分析：CIBERSORT 算法和 ssGSEA 分析表明，LRPS 风险评分与多种免疫细胞浸润相关，低风险组免疫评分、基质评分更高，抗肿瘤免疫反应更强。
- LRPS 与 TMB、免疫检查点及 m6A 基因的关联：高风险组肿瘤突变负荷（TMB）更高，免疫检查点如 CTLA4、CD27 等表达存在差异，m6A 相关基因表达也有显著不同。
- 治疗敏感性分析：高风险组患者对免疫治疗敏感性较低，对吉非替尼、厄洛替尼等药物可能更敏感，低风险组对阿昔替尼可能更敏感。
研究结论和讨论部分指出，该研究构建的 13 基因 LRPS 能准确预测 LUAD 患者预后，与肿瘤免疫微环境和药物敏感性密切相关，可指导临床制定个性化治疗策略。但研究也存在局限性，如可能遗漏更多溶酶体相关基因，LRPS 需前瞻性研究验证，还需实验进一步证实相关发现。尽管如此，此项研究仍为肺腺癌诊疗开辟了新方向，有望推动肺腺癌治疗进入更精准的时代，让更多患者受益。
