探秘新冠重症预测模型:贝叶斯与传统方法的较量

【字体: 时间:2025年03月11日 来源:BMC Medical Informatics and Decision Making 3.3

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  为评估新冠重症风险因素并构建预测模型,研究人员对比贝叶斯与传统方法,发现关键指标,提供建模指导。

  在新冠疫情的大背景下,早期准确预测住院新冠患者的病情恶化情况,对于临床决策至关重要。然而,现有的众多预测模型存在各种缺陷,比如多数模型未充分考虑共感染、生化因素等变量,对目标人群和护理环境描述不足,回归方程不完善,存在较高或不明的偏倚风险,且性能评估不充分。这些问题严重影响了预测模型的准确性和实用性,因此,开发更可靠的预测模型迫在眉睫。
英国布里斯托大学等机构的研究人员开展了相关研究,论文发表在《BMC Medical Informatics and Decision Making》上。该研究对比了贝叶斯逻辑回归(采用马蹄形先验和 Projective Prediction 变量选择方法)与传统的频率主义 LASSO 方法,旨在从人口统计学和实验室生物标志物数据预测新冠重症(死亡或入住 ICU)结果,同时为数据整理、变量选择和性能评估提供指导。

研究人员采用回顾性观察队列设计,数据来源于英国西南部三家 NHS 信托机构。研究对象为 2020 年 3 月至 10 月期间住院的成年新冠患者,共 756 例。这些患者被分为训练组(n = 534)和外部验证组(n = 222)。研究人员使用逻辑回归,基于患者的人口统计信息和入院 3 天内(或已入院且新冠检测阳性时)收集的 30 种生物标志物的首次检测结果,预测患者出现重症的可能性。

在技术方法上,研究人员首先对单个生物标志物进行分析,通过标准逻辑回归和贝叶斯逻辑回归(分别采用平坦先验和马蹄形先验),结合 5 折交叉验证(重复 20 次),评估单个生物标志物的预测能力。接着,使用所有有效生物标志物数据进行逻辑回归建模,并通过内部和外部验证评估模型性能。最后,采用 LASSO 和贝叶斯 Projective Prediction 两种方法进行变量选择,构建简化变量模型。

研究结果如下:

  • 队列描述:756 例患者中,57% 因新冠住院,其余为医院感染病例。训练组患者平均年龄 70 岁,44% 为女性,28% 出现重症;外部验证组患者平均年龄 74 岁,47% 为女性,37% 出现重症。外部验证组重症发生率更高,年龄更大,性别分布相似。
  • 单个变量预测:通过分析发现,年龄、部分生物标志物(如活化部分凝血活酶时间(APTT)(轻度异常)、凝血酶原时间(PT)(异常)、血液 pH(异常)等)与重症风险增加相关,而医院感染传播不是显著预测因素。部分生物标志物因样本量小等原因被排除在进一步分析之外。
  • 全变量模型评估:对使用所有有效生物标志物数据的模型进行评估,结果显示,所有模型在内部验证中的中位数 AUC 为 0.76 - 0.82,在外部验证中的中位数 AUC 为 0.67 - 0.71。虽然 LASSO 启发的 GLM 模型在内部验证中的 AUC 表现最佳,但所有模型的 95% AUC 差异区间存在重叠。在外部验证中,贝叶斯方法的中位数 AUC 差异最小,但除 LASSO 模型外,其他模型的 95% AUC 差异区间仍有重叠。
  • 简化变量模型:使用 LASSO 和 Projective Prediction 两种方法构建简化变量模型。LASSO 模型中,选择出现频率至少 50% 的变量构建简化模型,该模型使用 16 种生物标志物和年龄,外部验证 AUC 为 0.68。Projective Prediction 模型中,通过手动检查 AUC 性能,最终确定使用年龄、尿素、PT、中性粒细胞 - 淋巴细胞比率(NLR)和 C 反应蛋白(CRP)的四生物标志物模型,其内部验证 AUC 为 0.8,外部验证 AUC 为 0.71。

研究结论和讨论部分指出,本研究展示了使用复杂临床数据构建预测模型的挑战,强调了数据整理和模型选择中需要考虑的诸多因素。贝叶斯变量选择方法(如 Projective Prediction)虽然计算成本较高,但与传统方法相比,在 AUC 性能上有微小但稳定的提升,且能提供无偏系数,为变量选择提供系统方法。研究还发现,尿素、PT、CRP 和 NLR 是新冠重症的重要预测风险因素,分别反映了低血容量、凝血功能异常和炎症。然而,本研究也存在局限性,如病例数有限,导致参数估计不够精确,模型的普适性可能受限;生物标志物收集时间差异大,存在大量数据缺失。尽管如此,该研究为复杂临床数据的回归和预测建模提供了指导,其方法有望应用于其他传染病研究,对未来临床预测模型的发展具有重要意义。
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