3p24.3p23 重复与自闭症谱系障碍的关联研究:揭示罕见变异背后的奥秘

【字体: 时间:2025年03月11日 来源:Journal of Medical Case Reports 0.9

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  研究人员为探究染色体拷贝数变异(CNVs)与自闭症谱系障碍(ASD)关系,对携带 3p24.3p23 重复的患儿研究,发现该区域或与综合征型 ASD 相关。

  在生命的奇妙旅程中,基因就像隐藏在身体深处的神秘密码,掌控着我们的生长、发育和健康。然而,当这些密码出现错误时,就可能引发各种问题,尤其是在神经发育领域。染色体拷贝数变异(CNVs),如微缺失和微重复,便是基因密码出错的一种形式,它们是导致神经发育障碍(NDDs)和 / 或先天性缺陷(CDs)的重要原因,至少在 15% 的病例中发挥着作用。
目前,在探究 CNVs 与神经发育障碍关系的道路上,仍存在诸多迷雾。确定 CNV 增益的致病性贡献较为复杂,因为人类基因组对剂量增加的耐受性高于剂量减少。而且,CNVs 有时会通过干扰基因组区域的空间组织和 / 或破坏基因与其调控元件之间的正常相互作用来发挥致病作用。此外,虽然已发现一些罕见 CNVs 与特定<【《3p24.3p23 重复与自闭症谱系障碍的关联研究:揭示罕见变异背后的奥秘》】
【研究人员为探究染色体拷贝数变异(CNVs)与自闭症谱系障碍(ASD)关系,对携带 3p24.3p23 重复的患儿研究,发现该区域或与综合征型 ASD 相关。】
【染色体拷贝数变异 | 自闭症谱系障碍 | 神经发育障碍 | 3p24.3p23 重复 | 基因剂量改变 | 表型 - 基因型关联 | 基因调控 | SATB1 基因 | 临床评估 | 基因检测技术】
【国外】
【在生命的微观世界里,基因如同精密的 “生命密码”,掌控着人体的生长发育和健康平衡。一旦这些密码出现差错,就可能引发各种健康问题,尤其是在神经发育领域,基因的微小变化都可能带来巨大影响。染色体拷贝数变异(Chromosomal Copy Number Variations,CNVs),像是密码中的 “乱码”,作为一种常见的基因异常形式,它涵盖了微缺失和微重复等情况,是导致神经发育障碍(Neurodevelopmental Disorders,NDDs)和先天性缺陷(Congenital Defects,CDs)的重要 “幕后黑手”,至少在 15% 的病例中都能发现它的踪迹。

在当前的医学研究领域,虽然已经认识到 CNVs 与神经发育障碍密切相关,但仍有许多关键问题亟待解决。一方面,确定 CNV 增益的致病性机制极为复杂,人类基因组对基因剂量增加的容忍度较高,这使得判断其致病性更加困难。另一方面,CNVs 干扰基因正常功能的方式多样,除了改变基因剂量,还可能干扰基因组区域的空间组织,破坏基因与调控元件之间的正常协作,就像打乱了精密仪器的内部结构,让整个系统无法正常运转。此外,对于许多非复发性 CNVs,它们与特定疾病之间的联系依旧模糊不清,如同隐藏在迷雾中的神秘宝藏,等待着科学家去探索挖掘。

在自闭症谱系障碍(Autism Spectrum Disorder,ASD)的研究道路上,也面临着诸多挑战。非综合征型 ASD 的病因复杂,涉及多个因素,且具有不完全外显率,CNVs 在其中扮演着风险因素的角色,常常悄无声息地从看似正常的父母那里遗传给孩子。而综合征型 ASD 则多由新生变异引发,其中染色体 3 短臂区域的变异备受关注。然而,以往研究主要聚焦于 3pter - p25 综合征相关的微缺失,对于 3p24.3p23 区域的微重复研究却寥寥无几,这片神秘区域与 ASD 等神经发育障碍之间究竟有着怎样的联系,一直是个未解之谜。

为了突破这些困境,来自意大利罗马托雷维格塔大学、罗马托雷维格塔医院、罗马儿童医院等多个科研机构的研究人员,踏上了探索之旅。他们深入研究了一名近 3 岁意大利白人男性患儿的临床病例。该患儿不仅患有自闭症谱系障碍,还伴有发育迟缓、轻度畸形特征,以及心脏间隔缺损、胶质改变、胼胝体变薄和蛛网膜囊肿等先天性异常。研究发现,患儿携带一个 13 Mb 的新生 3p24.3p23 重复。这一研究成果发表在《Journal of Medical Case Reports》上,为相关领域的研究带来了新的曙光。

在研究过程中,研究人员运用了一系列先进的技术手段。基因组微阵列分析(Microarray Analysis,CMA)是其中的关键技术之一,研究人员借助单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)阵列平台,以 75 Kb 的高分辨率,精准地检测出患儿染色体 3p24.3p23 区域的重复情况。随后,位点特异性荧光原位杂交(Fluorescent In Situ Hybridization,FISH)技术大显身手,通过这项技术进行分离分析,不仅确定了该重复是新生起源,还揭示了其独特的结构特点。此外,研究人员还使用了多种标准化评估工具,像格里菲斯发育量表第三版(Griffiths III)、适应性行为评估系统第二版(Adaptive Behavior Assessment System - II,ABAS - II)、自闭症诊断观察量表第二版(Autism Diagnostic Observation Schedule,Second Edition,ADOS - 2)等,从多个维度对患儿的发育水平、适应性技能、社交沟通和行为特征进行了全面而细致的评估。

下面让我们具体看看研究的结果:

  • 患儿基本情况及基因检测:患儿是健康非近亲夫妇的第一个孩子,顺产出生。不过,出生时因轻度围产期窒息,APGAR 评分在第 1 分钟仅为 6 分,第 5 分钟才升至 8 分,同时还伴有小颌畸形、斜视和新生儿黄疸等问题。出生后,心脏检查发现室间隔轻度肥厚,还有假腱索,肺动脉多普勒超声速度也出现了改变,好在耳鼻喉科检查没有发现异常。出生 20 天时,进行了基因检测,CMA 结果显示染色体 3p24.3p23 区域存在约 13.4 Mb 的重复。经过 FISH 技术的进一步分析,证实了该重复是新生的,并且具有特定的结构。这个重复区域包含了 30 个 RefSeq 基因、15 个在线人类孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)基因和 7 个 OMIM 致病基因,根据美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)/ 临床基因组资源(Clinical Genome Resource,ClinGen)的指南,被判定为可能致病。
  • 发育及行为评估:在成长过程中,患儿的发育里程碑明显滞后。7 个月时才学会抬头,12 个月才能够控制躯干,12 个月开始尝试站立,到 24 个月才学会独立行走,26 个月时虽开始咿呀发声,但还没有说出真正的单词。睡眠方面,入睡困难、频繁醒来,还伴有肢体不安。喂养时也存在咀嚼困难,并且有便秘的情况。父母察觉到孩子在社交沟通和互动方面存在明显缺陷,行为模式较为刻板,还有强烈的感觉寻求行为,比如会有明显的视觉和触觉自我刺激行为,经常做手部动作、身体摇晃。研究人员在患儿 28 个月和 34 个月时分别进行了评估,结果显示,其发育商(Development Quotient,DQ)显著低于正常水平,适应性技能在各个方面都低于平均水平。ADOS - 2 的评分显示,患儿有较高的 ASD 症状水平,相关问卷也反映出他在社交沟通和行为方面存在诸多问题。经过综合判断,最终确诊患儿患有 ASD 和发育迟缓。

研究的结论和讨论部分具有深远意义。此次研究首次详细描述了与罕见的 3p24.3p23 重复相关的发育迟缓和自闭症症状,无论是从临床角度还是遗传角度,都为相关研究提供了宝贵的资料。从临床方面来看,全面深入的评估为后续的干预治疗和长期预后判断提供了重要依据;从遗传角度而言,尽管检测到的新生变异提示了致病性,但想要明确致病机制和具体的责任基因,仍面临诸多困难。研究人员推测,SATB1 基因的失调或许与患儿的表型存在关联。SATB1 基因作为一种染色质组织者,在多种生理过程中发挥着重要作用,它的异常与两种综合征有关,这两种综合征的表现与本患儿有不少相似之处。当然,也不能排除基因组重排可能对其他基因表达产生影响。

总的来说,这项研究为揭示染色体 3p24 区域与综合征型自闭症谱系障碍之间的关系迈出了重要一步,为后续研究指明了方向。未来,随着更多类似病例的研究不断深入,有望进一步明确相关基因的具体作用,为自闭症谱系障碍等神经发育障碍的诊断、治疗和干预提供更加精准有效的方法,帮助更多家庭走出困境。
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