干旱胁迫下内生细菌 Stenotrophomonas sp. C3 的多组学特征解析及其意义

【字体: 时间:2025年03月11日 来源:Microbiology 1.3

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  为探究干旱胁迫对 Stenotrophomonas sp. C3 的影响,研究人员开展多方面研究,揭示其特性及基因特征。

  从肉质旱生植物六角大花柱仙人掌(Cereus hexagonous L.)中分离出的内生细菌菌株嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonas) sp. C3,此前有研究报道它能增强辣椒(Capsicum annuum L.)幼苗的耐旱性。为了解干旱胁迫对嗜麦芽窄食单胞菌 sp. C3 的影响,研究人员对其形态变化、生物膜生成和代谢物合成进行了详细分析。在干旱条件下,该菌株呈现出聚集、团聚、大量产生生物膜以及生成渗透调节物质葡萄糖甘油(glucosylglycerol)等适应性特征。研究人员还通过全基因组测序(WGS)分析了该菌株的基因组特征。结果显示,嗜麦芽窄食单胞菌 sp. C3 的基因组大小为 3701554 bp,N50 值为 3684702,平均 G+C 含量为 66.68%。测序分析鉴定出了应激反应基因、胞外多糖生成基因、趋化相关基因、鞭毛形成基因,以及编码参与抗氧化防御和渗透调节物质生成的酶的基因。此外,还预测到了与植物生长促进相关的基因,特别是那些与磷和氮代谢相关的基因。对来自公共数据库的植物源嗜麦芽窄食单胞菌菌株进行泛基因组分析后发现,共有 8619 个基因簇,其中包括 2031 个核心基因和 6588 个壳基因,未发现软核基因和云基因。这一结果凸显了不同嗜麦芽窄食单胞菌菌株之间基因含量的显著差异。
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