从链霉菌中挖掘宝藏:FAST-NPS 平台助力生物活性天然产物发现

【字体: 时间:2025年03月12日 来源:Cell Systems 9.0

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  为挖掘链霉菌生物活性天然产物,研究人员开发 FAST-NPS 平台,成果助力生物医药发展。

  亮点:开发了用于在链霉菌(Streptomyces)中发现生物活性天然产物的 FAST-NPS 平台;FAST-NPS 能够从 11 株链霉菌菌株中克隆 105 个生物合成基因簇(BGC),成功率达 95%;在天蓝色链霉菌(S. lividans)TK24 中进行异源表达,从 12 个 BGC 中发现了 23 种产物;对 5 个 BGC 进行了表征,鉴定出 8 种具有抗菌或抗肿瘤活性的产物。
摘要:细菌、真菌和植物产生的天然产物(NPs)是药物先导化合物的重要来源,链霉菌物种因其能够产生多种生物活性化合物而尤为重要。在此,研究人员提出了一种用于在链霉菌中发现生物活性 NPs 的全自动、可扩展的高通量平台(FAST-NPS)。该平台整合了由自我抗性基因指导的计算生物合成基因簇(BGC)预测和优先级排序、自动克隆和异源表达、高通量发酵以及产物提取等技术。作为概念验证,研究人员从 11 株链霉菌菌株中克隆了 105 个 BGC(10 - 100 kb),成功率为 95%。在天蓝色链霉菌(Streptomyces lividans)TK24 中进行异源表达后,检测到 23 种 NPs,其中包括从 5 个 BGC 中获得的 8 种具有抗菌或抗肿瘤生物活性的 NPs。这项工作突出了 FAST-NPS 在加速生物活性 NPs 发现方面的潜力,有望用于生物医学和生物技术应用。本文的透明同行评审过程记录包含在补充信息中。
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