新物种发现:来自锯缘青蟹肠道的极地杆菌 Polaribacter uvawellassae sp. nov.
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时间:2025年03月13日
来源:Current Microbiology 2.3
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研究人员从锯缘青蟹肠道分离菌株,经多方面分析,发现极地杆菌新物种,意义重大。
从锯缘青蟹(Scylla serrata)肠道中分离出了一株革兰氏染色阴性、严格需氧、杆状且无鞭毛的菌株,命名为 SLMDC-22T。基于 16S rRNA 基因序列的分子系统发育分析表明,菌株 SLMDC-22T属于极地杆菌属(Polaribacter),与黄河站极地杆菌(P. huanghezhanensis)的相似度为 96.9%,与太平洋极地杆菌(P. pacificus)的相似度为 96.5%,与腔隙极地杆菌(P. lacunae)的相似度为 95.8% ,与海洋极地杆菌(P. marinivivus)的相似度为 94.1%。菌株 SLMDC-22T的 DNA 的 G+C 含量为 30.3%。该菌株在 4–34°C(最适温度为 23°C)、pH 5–9(最适 pH 为 7.0)以及 0.5–2.0%(w/v)NaCl(最适浓度为 2%)的条件下均能生长。主要脂肪酸为异 C15:0 。主要极性脂质包括磷脂、磷脂酰单甲基乙醇胺、磷脂酰乙醇胺、氨基脂质、糖脂、氨基磷脂和一种未知极性脂质。主要呼吸醌为 MK-6。基于全基因组分析,该菌株与亲缘关系最近的两个物种黄河站极地杆菌和太平洋极地杆菌的直系同源平均核苷酸同一性(ANI)分别为 87.3% 和 75.7%。此外,与黄河站极地杆菌和太平洋极地杆菌的数字 DNA-DNA 杂交(dDDH)值分别为 75.8% 和 19.6%。值得注意的是,SLMDC-22T有 25 个基因与氮代谢相关,涉及反硝化作用、硝酸盐氨化作用、铵同化作用和亚硝化应激。表型、基因型、系统发育和化学分类学数据表明,菌株 SLMDC-22T代表了极地杆菌属的一个新物种,提议将其命名为 Polaribacter uvawellassae sp. nov.。模式菌株为 SLMDC-22T(=KCTC 102289T=MCCC 1K09222T)。
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