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为探究 U6 小核 RNA（U6 snRNA）在逆转录病毒感染中的动态变化，研究人员以 SIV 感染细胞为模型，发现感染后 U6 snRNA 从细胞核转移到细胞外囊泡（EVs），这一发现有助于理解 HIV 感染机制。
在微观的细胞世界里，一场与病毒相关的 “神秘事件” 正在上演。细胞外囊泡（Extracellular Vesicles，EVs）作为细胞间通信的重要 “信使”，在 HIV 感染过程中扮演着关键角色。它能运输各种生物活性分子，包括宿主和病毒的成分，对 HIV 的发病机制和宿主 - 病毒相互作用有着深远影响。而 U6 小核 RNA（U6 small nuclear RNA，U6 snRNA）作为剪接体的关键组成部分，主要存在于细胞核中，在 RNA 剪接过程中发挥着不可或缺的作用，就像一把精准的 “剪刀”，对前体 mRNA 进行剪接加工，确保基因表达的正常进行。
此前研究虽揭示了急性 SIV 感染时血浆 EVs 中 U6 snRNA 水平与病毒峰值有关，但 U6 snRNA 在细胞和 EVs 中的动态变化，尤其是在 HIV 等逆转录病毒感染中的情况，仍如同迷雾般笼罩，亟待探索。为了揭开这层神秘面纱，来自国外的研究人员开展了一项深入研究，相关成果发表在《SCIENCE ADVANCES》上。
研究人员为了深入了解 U6 snRNA 及其相关蛋白在逆转录病毒感染中的分布情况，以 SIV - 17EFr 和 SIV - B670 感染的人类 CEMx174 细胞为研究模型。他们运用了多种关键技术方法，其中包括：通过纳米流式细胞术（Nanoflow cytometry，NFCM）和透射电子显微镜（Transmission electron microscopy，TEM）对细胞外囊泡进行表征分析；采用定量聚合酶链反应（quantitative polymerase chain reaction，qPCR）检测 U6 和 U1 snRNA 的水平；利用蛋白质组学技术和加权基因共表达网络分析（Weighted gene coexpression network analysis，WGCNA）探索感染后蛋白质谱的变化；借助免疫印迹（Western blot）技术检测 U6 snRNA 相关蛋白的表达情况 。
下面来看具体的研究结果：
- 细胞外囊泡的特征：SIV - 17EFr 和 SIV - B670 感染 CEMx174 细胞后，细胞活力下降，且 SIV - B670 感染组下降更明显。通过对细胞外囊泡的分离和表征发现，SIV - B670 感染组的细胞外囊泡数量较多，且有更多较小颗粒。同时，研究还鉴定了细胞外囊泡的表面标记，确认了其特征。
- U6 snRNA 水平和分布的改变：qPCR 检测显示，SIV 感染后，细胞外囊泡中的 U6 snRNA 水平显著升高，而细胞核中的 U6 snRNA 水平明显降低，U1 snRNA 水平在细胞核中也降低，但在细胞外囊泡中无明显变化。此外，研究发现这种变化在乙肝病毒（HBV）感染中并未出现，说明这可能是逆转录病毒感染特有的现象。
- SIV 感染与蛋白质变化：蛋白质组学分析表明，SIV 感染后，细胞质、细胞核和细胞外囊泡中的蛋白质谱发生了显著变化。细胞核中差异表达蛋白数量最多，且感染相关的蛋白变化与代谢途径、核酸加工等过程有关。
- 核酸代谢和剪接体通路相关蛋白：通过 WGCNA 分析发现，在细胞核和细胞外囊泡中，与 SIV 感染相关的蛋白模块与核酸代谢和剪接体通路密切相关，且这些通路中的蛋白在感染后发生了明显变化。
- U6 snRNA 相关蛋白：研究还检测了 U6 snRNA 相关蛋白，发现大多数蛋白在细胞外囊泡与细胞质、细胞核中的变化相反，同时细胞外囊泡表面的一些免疫相关标记也发生了改变。
综合研究结果和讨论部分，此次研究意义重大。它首次清晰地揭示了 U6 snRNA 在逆转录病毒感染过程中从细胞核转移到细胞外囊泡的现象，这一转移可能导致细胞内 RNA 剪接异常，进而影响基因表达。同时，研究还发现了一系列与 U6 snRNA 相关的蛋白变化，以及它们与病毒感染之间的紧密联系。这些发现为深入理解 HIV 感染机制提供了全新的视角，有助于未来开发更有效的治疗策略。例如，针对 U6 snRNA 及其相关蛋白的功能研究，有望为开发干扰 HIV 复制的小分子抑制剂提供理论依据。此外，探索细胞外囊泡包裹 RNA 加工元件的机制，也将进一步揭示 HIV 与宿主细胞 RNA 加工机制之间的相互作用，为攻克 HIV 感染相关疾病带来新的希望。
