单细胞 RNA 测序新方法 “recall” 有效防止过聚类

研究人员开展 scRNA-seq 过聚类问题研究，提出 “recall” 方法，性能优异且分析速度快。

　　标准的单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）流程几乎总会把无监督聚类作为识别具有生物学差异细胞类型的关键步骤。这些流程的后续步骤是对已识别的细胞簇进行差异表达检测。当算法出现过聚类时，下游分析可能会产生误导性结果。在这项研究中，研究人员提出了 “recall”（利用人工变量进行校准聚类）方法，通过控制在进行差异表达分析时重复使用相同数据（即通常所说的 “双重使用”）的影响，来防止过聚类情况的发生。重要的是，该方法可应用于多种聚类算法。通过真实数据和模拟数据测试，“recall” 展现出了顶尖的聚类性能，甚至能在个人笔记本电脑上快速分析大规模的 scRNA-seq 研究数据。