探秘 Peribunyaviridae 科病毒微卫星：解锁进化与宿主选择之谜

研究人员分析 151 个Peribunyaviridae基因组微卫星，发现其与进化、宿主确定有关，意义重大。

　　Peribunyaviridae病毒科隶属于布尼亚病毒目（Bunyavirales），包含四个属：Herbevirus（3 种）、Orthobunyavirus（125 种已分类和 14 种未分类）、Pacuvirus（5 种）、Shangavirus（1 种），还有 3 个未分类成员。这些病毒的基因组都有三个片段：大（Large，L）、中（Medium，M）、小（Small，S）。简单序列重复（Simple sequence repeats，SSR），即微卫星，可用于揭示病毒间的进化关系。本研究旨在提取并分析 151 个Peribunyaviridae基因组中微卫星的发生率、组成和分布情况，探究其在病毒进化和宿主确定方面的潜在意义。研究过程中使用了国际病毒分类委员会（ICTV）、美国国立生物技术信息中心（NCBI）、微卫星识别工具（MISA）、多序列比对软件（MAFFT）和分子进化遗传分析软件（MEGA）等多种数据库、在线工具及软件。研究的基因组片段平均大小分别为：L 片段约 6.909kbp、M 片段约 4.43kbp、S 片段约 0.98kbp，对应的平均 GC 含量分别为 33.66%（L）、34.47%（M）、40.10%（S）。研究共提取出 8517 个 SSR 和 713 个复合简单序列重复（compound simple sequence repeats，cSSR）。三个片段分别包含 1651、907 和 228 个单碱基重复基序。双碱基重复基序在 L、M、S 片段中的数量分别为 2855、1895 和 278。此外，超过 90% 的 SSR 位于编码区（CDS）。系统发育分析表明，三个基因组片段存在差异进化。单碱基 SSR 仅定位在 A/T 区域的物种主要以蚊子为宿主，这表明其在宿主确定方面可能发挥作用。这些微卫星在基因组内和基因组间的发生率没有明显规律，暗示着它们在基因组功能和进化中有着独特作用。