代谢组学与机器学习助力系统性轻链淀粉样变性诊断生物标志物筛选

【字体: 时间:2025年03月14日 来源:Annals of Hematology 3

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  研究针对系统性轻链(AL)淀粉样变性诊断难题,筛选生物标志物,发现相关代谢物及通路,助力早期诊断。

  在医学的神秘世界里,系统性轻链(AL)淀粉样变性就像一个隐藏在暗处的 “神秘杀手”。它是一种由浆细胞克隆性增殖引发的罕见疾病,异常的轻链错误折叠后,会聚集形成不溶性的淀粉样纤维,悄无声息地 “入侵” 人体各个器官,严重威胁着患者的生命健康。在西方国家,每年每百万人中约有 8 - 12 人被它 “盯上”。
由于 AL 淀粉样变性的临床表现复杂多样,目前还缺乏特异性的实验室和影像学检查手段,这使得医生们在诊断时困难重重,误诊、漏诊的情况时有发生。诊断的延迟更是让患者的预后雪上加霜,在有效治疗出现之前,患者的中位总生存期(OS)仅有短短 12 个月左右。尽管近年来治疗手段有所进步,患者的中位 OS 提升到了 4.6 年,但仍有高达 25% 的患者在确诊后的 6 个月内离世。因此,寻找敏感、特异的生物标志物用于早期诊断,成为了医学领域亟待解决的难题。

为了攻克这一难题,北京大学第一医院的研究人员挺身而出。他们开展了一项旨在通过代谢组学和机器学习方法,筛选 AL 淀粉样变性诊断生物标志物的研究。该研究成果发表在《Annals of Hematology》上,为这一疾病的诊断带来了新的希望。

研究人员在这项研究中主要运用了以下关键技术方法:首先,收集样本,从 70 例新诊断的系统性 AL 淀粉样变性患者、48 例新诊断的多发性骨髓瘤(MM)患者和 29 例健康对照(HCs)中采集外周静脉血样本;其次,采用高效液相色谱 - 质谱(HPLC - MS)技术对样本进行代谢组学分析;然后,运用多种统计分析方法和机器学习算法,如主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘法判别分析(OPLS - DA)、随机森林(RF)算法等,筛选差异代谢物并评估其诊断效能;最后,利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析探索差异代谢物相关的代谢通路。

研究结果主要有以下几方面:

  1. 患者基线特征:研究共纳入 147 名参与者,包括 70 例 AL 淀粉样变性患者、48 例 MM 患者和 29 例 HCs。三组人群在年龄和性别上无显著差异。在 AL 淀粉样变性患者中,87.1% 为 λ 亚型,肾脏和心脏是最常受累的器官,分别占 88.6% 和 54.3%。MM 患者均符合症状性 MM 标准,大部分处于较高分期1
  2. 代谢谱差异分析:研究检测到 850 种代谢物,通过筛选得到 322 种至少在三分之二样本中存在的代谢物。PCA 和 OPLS - DA 分析显示,AL 淀粉样变性患者与 HCs 的代谢谱存在明显差异,与 MM 患者的代谢谱也有一定区别,且 OPLS - DA 模型具有良好的预测效能和可靠性2
  3. 差异代谢物筛选:依据严格的筛选标准,确定了 AL 与 HCs 组间的 12 种差异代谢物,AL 与 MM 组间的 13 种差异代谢物。这些差异代谢物在两组间的表达水平存在显著差异3
  4. 潜在诊断生物标志物筛选:运用 RF 算法,发现植物鞘氨醇和不对称二甲基精氨酸(ADMA)在区分 AL 淀粉样变性与 HCs 方面表现出色,植物鞘氨醇在区分 AL 与 MM 时也有一定潜力。它们的受试者工作特征曲线(ROC)下面积(AUC)较高,诊断的敏感性和特异性良好45
  5. 代谢通路分析:与 HCs 和 MM 相比,AL 淀粉样变性患者在淀粉和蔗糖代谢、戊糖和葡萄糖醛酸相互转化等代谢通路存在显著变化。这些通路的改变可能与 AL 淀粉样变性的发病机制密切相关67

研究结论表明,代谢组学结合机器学习技术,成功筛选出植物鞘氨醇作为 AL 淀粉样变性早期诊断的潜在生物标志物,同时发现淀粉和蔗糖代谢、戊糖和葡萄糖醛酸相互转化这两条代谢通路可能反映了 AL 淀粉样变性发展和进展的关键病理过程。这一研究成果为 AL 淀粉样变性的早期诊断提供了新的方向和潜在的生物标志物,有助于提高疾病的早期诊断率,改善患者的预后。不过,该研究也存在样本量有限、潜在生物标志物需进一步验证等局限性,未来还需要更多的研究来深入探索和验证这些发现,为攻克 AL 淀粉样变性这一难题提供更坚实的理论和实践基础。
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