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为探究口腔微生物组中的抗菌耐药基因（ARGs），研究人员开展系统回顾，发现诸多特性，为后续研究奠基。
### 口腔微生物组抗菌耐药基因研究：现状、成果与未来
在全球健康领域，抗菌耐药（AMR）已成为严峻挑战，世界卫生组织将其列为威胁人类的十大因素之一，2019 年更是直接导致 127 万人死亡。口腔作为一个微生物种类繁多且密集的环境，逐渐被视为抗菌耐药基因（ARGs）的重要储存库。这些基因可借助水平基因转移机制，如结合、转化和转导，在不同细菌物种间传递，不仅会在口腔内扩散耐药性，还可能传播到口腔外，对整体健康构成潜在威胁。
在此背景下，为了深入了解口腔微生物组中的 ARGs，来自英国曼彻斯特大学（The University of Manchester）和谢菲尔德大学（The University of Sheffield）的研究人员对相关研究进行了系统回顾，并将研究成果发表在《Evidence - Based Dentistry》杂志上。
此次研究主要运用了两种关键技术方法。一是聚合酶链反应（PCR），它能针对特定已知的 ARGs 进行检测，但局限于预先设定的目标基因；二是下一代测序（NGS）宏基因组学技术，该技术无需预先知晓基因信息，可对样本中的所有 DNA 进行测序，从而更全面、无偏差地检测 ARGs，还能发现新的或未预期的基因以及更多携带 ARGs 的细菌物种 。研究人员检索了 Medline、Embase、Web of Science、CINAHL 和 Scopus 等多个数据库，筛选出 2015 年 1 月至 2023 年 8 月期间符合要求的临床研究。
在研究结果部分，从初步检索到的 580 项研究中，最终仅有 15 项符合纳入标准。这些研究来自 12 个不同国家，样本涵盖了 1486 名参与者（其中 1 项研究未报告参与者数量）。
在检测方法对比方面，基于 PCR 的研究平均检测到 7 个 ARGs（范围为 1 - 20 个），而 NGS 研究平均检测到 34 个 ARGs（范围为 7 - 70 个）。同时，PCR 研究平均识别出 4 种携带 ARGs 的细菌物种，共鉴定出 25 种；NGS 研究则平均识别出 65 种，共鉴定出 177 种。这清晰地显示出 NGS 在检测 ARGs 和相关细菌物种数量上的优势。
从 ARGs 的分布来看，研究在口腔六个区域共鉴定出 159 种独特的 ARGs，它们对 22 类抗生素具有耐药性。其中，龈上生物膜和唾液中的 ARGs 丰富度最高，龈上生物膜中存在对 19 类抗生素耐药的基因。值得注意的是，有 49 种 ARGs，包括四环素和大环内酯类耐药基因，在所有采样部位都被发现，表明其在口腔内广泛分布。
在细菌物种与 ARGs 关联研究中，13 项研究报告了相关细菌物种。4 项研究发现与感染性心内膜炎等远处感染相关的链球菌物种携带 ARGs，同时利用 PCR 和 NGS 方法在口腔不同部位检测到了 ESKAPE 病原体（一组高毒力的多重耐药细菌）及其携带的 ARGs，这无疑令人担忧。
另外，对比健康和患病状态下的口腔微生物组发现，健康的口腔微生物组在抗生素类别水平上拥有更多样化的抵抗组（resistome，即口腔微生物群中所有 ARGs 的集合）。在龋齿病例中，龈上抵抗组和唾液抵抗组中四环素 ARGs 占主导地位。
综合这些研究结果，研究人员得出结论：分析这 15 项研究中的口腔抵抗组，发现有 3 种 ARGs 存在于口腔所有部位，这表明存在核心抵抗组。尽管 NGS 研究比 PCR 研究提供了更深入的见解，但整体研究基础仍较为薄弱，未来需要进一步开展全面研究，以完整绘制口腔抵抗组图谱。
这项研究意义重大，它为口腔微生物组中 ARGs 的研究提供了重要参考，让人们对口腔微生物耐药情况有了更清晰的认识。同时也为后续研究指明了方向，未来应优先采用 NGS 宏基因组学技术，并开展纵向研究，探究抗生素暴露、口腔卫生习惯和全身健康状况等因素对口腔微生物组中 ARGs 动态变化的影响，这将有助于制定更有效的抗菌策略，应对日益严重的抗菌耐药问题，保障公众健康。
