LINC02363:败血症早期诊断与治疗的新希望

【字体: 时间:2025年03月16日 来源:BMC Immunology 2.9

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  为解决败血症早期诊断难题,研究人员探究相关 lncRNAs,发现 LINC02363 或可作新生物标志物。

  败血症,这个隐藏在人体健康背后的 “杀手”,时刻威胁着人们的生命安全。它是一种因宿主免疫反应失控引发器官功能障碍的危急病症,严重时可发展为感染性休克。在全球范围内,败血症的发病率和死亡率一直居高不下。早期发现并及时治疗败血症,能显著改善患者的预后,但现有的诊断方法却困难重重。目前,败血症的诊断主要依赖临床症状和传统生物标志物,像 C 反应蛋白(CRP)和降钙素原(PCT),然而它们的特异性和敏感性欠佳,难以满足早期干预和治疗的需求。因此,寻找更有效的生物标志物,提升败血症的诊断准确性和预后评估水平,成为了医学领域亟待攻克的难题。
为了突破这一困境,来自成都第五人民医院重症监护室、山东第二医科大学临床医学院以及西南医科大学附属医院急诊科的研究人员展开了深入研究。他们的研究成果发表在《BMC Immunology》上,为败血症的诊断和治疗带来了新的曙光。

研究人员采用了多种关键技术方法。首先,从中国国家基因库(CNGBdb)获取败血症患者的转录组数据,同时在西南医科大学附属医院采集了 23 名败血症患者和 10 名健康志愿者的静脉血样本。接着,运用在线工具 iDEP97 进行转录组数据分析,通过主成分分析(PCA)降维处理并识别异常样本,再利用 DEseq2 方法筛选差异表达的 RNA。然后,使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建基因表达数据矩阵,筛选核心基因。此外,还借助生存曲线分析、荟萃分析、基因集富集分析(GSEA)、单细胞测序以及定量聚合酶链反应(qPCR)等技术,对关键基因进行深入研究。

在研究结果方面:

  • 差异表达 RNA 筛选:通过 PCA 分析,发现健康组和败血症组样本聚类明显,无异常样本。按照 | FC|≥2、FDR<0.05 的标准筛选,共鉴定出 2348 个差异表达的长链非编码 RNA(lncRNAs)和 5125 个差异表达的信使核糖核酸(mRNAs)。
  • WGCNA 及核心基因鉴定:选择软阈值 7 进行 WGCNA 分析,识别出 5 个模块,其中棕色模块与败血症表型显著相关。进一步分析发现,LINC02363(lncRNA)、动力蛋白轻链 Tctex 型 1(DYNLT1)和 Fcγ 受体 1B(FCGR1B)为关键基因,且 LINC02363 与 DYNLT1、FCGR1B 表达呈正相关。
  • 生存曲线分析:结合公共数据库 GSE65682 进行生存曲线分析,结果显示 DYNLT1 表达与患者生存呈负相关,FCGR1B 表达与生存呈正相关,二者可能作为预测败血症患者生存的生物标志物,且在败血症组中高表达。
  • 荟萃分析:对 DYNLT1 和 FCGR1B 进行荟萃分析,发现它们在败血症幸存者和非幸存者中表达模式不同,表明这两个基因在败血症生物标志物研究中可能发挥不同作用。
  • GSEA 富集分析:对 LINC02363 进行 GSEA 富集分析,发现其在 “单纯疱疹病毒 1 型感染”“结核病” 相关基因集以及核糖体功能和氧化磷酸化通路中显著富集,提示 LINC02363 在炎症反应、免疫调节和细胞应激反应、能量代谢中发挥作用。
  • 单细胞测序:通过单细胞测序,将样本细胞分为九组,发现 DYNLT1 广泛分布于所有免疫细胞,FCGR1B 主要定位于巨噬细胞谱系。
  • qPCR 实验:qPCR 实验表明,与健康对照组相比,败血症组中 FCGR1B、LINC02363 和 DYNLT1 的表达水平显著上调。

研究结论和讨论部分指出,败血症是一种复杂的临床综合征,现有生物标志物存在局限性。LINC02363、DYNLT1 和 FCGR1B 作为潜在的新型生物标志物,有望为败血症的早期诊断提供更精准、更及时的依据,尤其是在免疫调节和免疫反应早期阶段。不过,目前研究存在数据集异质性的问题,且 LINC02363 在败血症免疫反应中的具体作用尚未经直接功能实验验证。未来研究需加强数据标准化和归一化,运用 RNA 干扰、CRISPR-Cas9 等技术深入探究 LINC02363 的免疫调节机制,通过动物模型实验进一步验证其功能,推动其在临床诊断和治疗中的应用。这一研究成果为败血症的诊疗开辟了新方向,具有重要的理论意义和潜在的临床应用价值,为后续深入研究奠定了坚实基础。
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