开发叶绿体基因组 SNP 引物助力杜鹃花属分类与进化研究

为解决杜鹃花属分类难题，研究人员开发 SNP 引物，发现 psbE-petL 和 rbcL 引物优势显著，意义重大。

　　杜鹃花（Rhododendron L.）是世界上最受欢迎的花卉之一。然而，基于形态特征对杜鹃花进行物种分类和演化研究一直存在很大争议，这也限制了新品种培育时亲本的选择。为解决这些问题，本研究针对杜鹃花种质中具有高多态性和良好通用性的叶绿体基因组开发了单核苷酸多态性（SNP）引物。研究选用了 11 对引物进行筛选，其中 4 对来自先前已发表的文献，另外 7 对是在分析 19 种已公布的杜鹃花完整叶绿体基因组的基础上新设计的。共选用 45 份杜鹃花种质进行测试，包括 21 种野生种用于通用性和多态性测试，24 个栽培品种用于进一步的转移性测试。结果显示，与其他 9 对引物相比，psbE-petL 和 rbcL 引物表现出更好的特异性、更高的多态性和更强的转移性。其中，psbE-petL 是本研究新开发的引物，其片段长度在 682 至 689bp 之间，核苷酸多样性为 0.09902；rbcL 引物来自之前的报道，片段长度在 536 至 539bp 之间，核苷酸多样性为 0.07849。基于 psbE-petL 和 rbcL 串联序列进行的系统发育分析和单倍型分析，能够有效区分不同亚属的野生杜鹃花，同时也能区分杜鹃组（Azalea）和杜鹃花组（Rhododendron）的栽培品种。本研究开发的 SNP 引物为今后杜鹃花栽培品种和物种之间的母本鉴定及系统发育分析提供了参考。