三种降解椰油酰胺丙基甜菜碱(CPB)或甜菜碱细菌的基因组草图：Cupriavidus sp. CuC1、Variovorax sp. VaC1和Pseudomonas sp. PsB

本研究报道了能降解表面活性剂CPB或渗透调节剂甜菜碱的三种环境细菌基因组特征。来自美国的研究人员通过土壤富集培养分离出Pseudomonas sp. PsB（专性降解甜菜碱）、Cupriavidus sp. CuC1和Variovorax sp. VaC1（专性降解CPB），完成Illumina NovaSeq X平台测序和SPAdes组装，获得覆盖度381-650×的基因组草图。该研究为解析表面活性剂生物降解机制及环境修复提供重要菌种资源。

　　科研人员成功解析了三株具有特殊代谢能力的细菌基因组特征。Pseudomonas sp. PsB能以N,N,N-三甲基甘氨酸（甜菜碱）为唯一碳源生长，而Cupriavidus sp. CuC1和Variovorax sp. VaC1则专性降解化妆品和消防泡沫中的表面活性剂椰油酰胺丙基甜菜碱(CPB)。这些菌株分离自美国某空军基地附近91-203 cm深度的污染土壤，通过氨矿物盐(AMS)培养基富培养获得。研究采用Illumina NovaSeq X平台进行双端150 bp测序，经Trimmomatic质控后使用SPAdes v4.0.0完成基因组组装，最终获得contig N₅₀达57-987 kb、基因组覆盖度381-650×的高质量草图。值得注意的是，16S rRNA基因比对显示PsB与Pseudomonas plecoglossicida NBRC 103162相似度达99.93%。该成果为揭示CPB生物降解途径及开发环境修复技术奠定了重要基础。