女性健康益生菌新发现:乳酸乳杆菌ORD 0998(CECT 30660)全基因组测序与功能解析
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时间:2025年03月21日
来源:Microbiology Resource Announcements 0.7
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编辑推荐:来自西班牙的研究团队针对女性生殖道益生菌开发需求,完成了乳酸乳杆菌Lacticaseibacillus paracasei ORD 0998(CECT 30660)的高质量基因组测序。该菌株分离自健康女性阴道分泌物,采用Illumina MiSeq和ONT MinION双平台测序技术,获得3.15 Mb基因组(GC含量46.33%),包含抗炎蛋白P40/P75等关键功能基因,为开发新型女性微生态制剂提供重要分子基础。
作为革兰氏阳性菌的乳酸乳杆菌(Lacticaseibacillus paracasei)常见于乳制品及人类消化道,其益生特性备受关注。研究团队从健康女性阴道分泌物中分离获得ORD 0998菌株(保藏号CECT 30660),通过MRS培养基在37°C厌氧条件下培养17-24小时。采用MagAttract HMW DNA Kit提取高质量DNA后,同步进行Illumina MiSeq(2×300 bp)和Oxford Nanopore(ONT MinION R9.4.1)双平台测序,经BBmap(Q>20)和NanoFilt(Q>7)质控后,使用Unicycler v0.4.8组装获得仅含2个contig的高质量基因组(N50=5,285)。NCBI PGAP注释显示该菌株携带16S rRNA(经BLASTn验证与CP048003.1 100%匹配)及具有抗炎功能的P40/P75蛋白编码基因,为开发靶向女性健康的下一代益生菌奠定重要基础。
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