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研究人员对 SH-SY5Y 细胞进行研究,发现铅处理和分化影响 ψ 位点及相关酶,有助于探索其调控机制。
亮点:
- 假尿苷(ψ)在细胞状态变化时展现出可塑性。
- 铅处理比细胞分化揭示出更多占据率更低的 ψ 位点。
- 稳定位点与管家 mRNA 相关,可变位点反映外部信号。
- 研究结果揭示了 TRUB1 和 PUS7 酶在 ψ 动态变化中潜在的共调控关系。
摘要:mRNA 的化学修饰,如假尿苷(ψ),能够调控基因表达。然而,人们对其调控机制,尤其是在神经元中的调控机制知之甚少。研究人员应用纳米孔直接 RNA 测序技术,探究 SH-SY5Y 细胞中 ψ 的动态变化,该研究模拟了自然和非自然细胞状态下的两种干扰:维甲酸介导的细胞分化(健康状态)和暴露于神经毒性物质铅(不健康状态)。研究发现,部分 ψ 修饰酶的表达会随着生理条件发生显著变化。从整体来看,铅处理后的细胞比未处理细胞和分化细胞具有更多的 ψ 位点,但相对占据率更低。许多高度可变的 ψ 位点伴随着 ψ 修饰酶的稳定表达,这表明存在反式调控。在三种细胞状态下,许多 ψ 位点都保持稳定,这暗示其具有 “管家” 功能。这项研究有助于深入探究神经元中控制 ψ 修饰的机制,以及在细胞应激反应中其可能的保护作用。