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新冠病毒(SARS-CoV-2)变异株不断涌现,现有疫苗效力受影响。本文研究了副流感病毒 5(PIV5)载体鼻喷式新冠疫苗(如 CVXGA1 等)在仓鼠模型中的免疫原性和功效,发现其单剂可诱导中和抗体,加强免疫效果显著,有望成为对抗变异株的有效疫苗。
### 研究背景
2019 年 12 月,SARS-CoV-2 在中国武汉首次出现,此后众多变异株不断涌现。世界卫生组织将影响病毒传播、增加致病性或降低疫苗有效性(免疫逃逸)的变异株定义为关注变异株(VOC),如阿尔法(alpha)、贝塔(beta)、伽马(gamma)、德尔塔(delta)和奥密克戎(omicron)等。
目前,美国批准了四种 SARS-CoV-2 疫苗,全球已接种超 130 亿剂疫苗,但变异株的免疫逃逸和疫苗诱导的免疫力下降,使得现有疫苗对变异株的效力降低。例如,接种两剂辉瑞 mRNA 疫苗的个体血清对 delta 变异株的中和抗体滴度比对 alpha 变异株低三到五倍;奥密克戎康复者血清对奥密克戎的中和能力比对原始毒株 WA1 低八倍 。因此,迫切需要开发对变异株具有持久保护免疫力的新型疫苗。
PIV5 是副黏病毒科的一种负链单链 RNA 病毒。PIV5 载体疫苗经鼻内(IN)免疫后可在呼吸道中活跃复制,能产生抗原特异性细胞反应和黏膜免疫,包括抗原特异性 IgA 抗体和长寿的 IgA 浆细胞 。一种表达 SARS-CoV-2 武汉(原始毒株;WA1;CVXGA1)刺突蛋白的 PIV5 载体疫苗已在小鼠和雪貂中显示出有效性 ,目前正在美国进行 2 期临床评估。本研究利用金黄地鼠模型,评估 CVXGA1 及其他 PIV5 载体疫苗对 SARS-CoV-2 变异株的免疫原性和功效。
材料和方法
- 细胞:使用 Vero E6 细胞、无血清(SF)Vero 细胞和 Vero-TMPRSS2 细胞,分别在特定培养基中培养,置于 37°C、5% CO2环境,定期检测支原体污染,对用于生产疫苗的细胞系进行核型分析验证。
- 质粒和病毒拯救:按照先前描述构建编码 PIV5 反基因组的质粒和重组 PIV5 。构建分别表达 SARS-CoV-2 WA1、alpha、gamma、delta 和 omicron 变异株刺突(S)基因的质粒(CVXGA1、CVXGA3、CVXGA5、CVXGA13 和 CVXGA14),以及同时表达 S 和核蛋白(N)的质粒(CVXGA2)。通过转染或电穿孔将相关质粒和 T7 聚合酶导入 SF Vero 细胞,回收并扩增病毒,用 RT-PCR 和 Sanger 测序验证病毒基因组。
- 病毒增殖:重组 PIV5 病毒在 SF Vero 细胞中以 0.001 PFU 的感染复数(MOI)在特定培养基中培养 5 - 7 天,收获培养基离心去除细胞碎片,与缓冲液混合后分装、冻存。SARS-CoV-2 病毒在 Vero 细胞中培养,不同变异株来源不同,如 WA1 和 alpha 变异株来自 BEI Resources,omicron BA1 变异株由佐治亚大学 Jeff Hogan 博士提供,delta 变异株由华盛顿大学 Michael Gale, Jr. 博士提供。对 delta 变异株进行分离、培养和全基因组测序验证。
- 免疫荧光测定:用 PIV5、CVXGA1 等病毒以 0.01 的 MOI 感染 Vero 细胞 3 天,固定后用特定抗体孵育,再用荧光标记的二抗孵育,最后用显微镜成像,检测病毒感染细胞中的蛋白表达。
- 地鼠:选用 5 - 7 周龄的金黄地鼠,单笼饲养在动物生物安全二级(ABSL2)设施,自由进食和饮水。实验前在佐治亚大学的生物科学动物设施进行预处理,感染和感染后实验在 ABSL3 设施进行。实验中通过腹腔注射麻醉地鼠进行免疫、采血和感染操作。
- 地鼠的免疫和感染:鼻内免疫时,将麻醉地鼠仰卧,用移液器将 100 μL 接种物滴在其鼻子上,使其流入呼吸道。使用从临床站点获得的 COVID-19 mRNA 疫苗,复溶后肌肉注射 2 μg/50 μL 。设置不同的研究组,如 AE19 组地鼠接受单剂鼻内免疫后,在不同时间采血、感染 SARS-CoV-2 WA1 或 alpha 变异株;AE23 组地鼠免疫后感染 delta 变异株;AE24 组地鼠进行多次免疫,包括 mRNA 疫苗和 CVXGA1 等,最后感染 delta 变异株。实验过程中监测地鼠体重变化,感染后采集肺组织检测病毒载量。
- 酶联免疫吸附测定:用酶联免疫吸附测定(ELISA)检测地鼠血清中抗 SARS-CoV-2 S 和受体结合域(RBD)的体液反应。将 SARS-CoV-2 S 或 RBD 包被在 96 孔板上,加入地鼠血清孵育,再加入辣根过氧化物酶标记的二抗,显色后测定 OD450值,计算抗体滴度。
- 中和测定:在生物安全三级(BSL3)设施中进行微量中和测定,检测地鼠产生的 SARS-CoV-2 中和抗体(nAbs)。将地鼠血清热灭活后倍比稀释,与 SARS-CoV-2 WA1、delta 或 omicron 变异株混合孵育,再接种到相应细胞上,培养后固定、免疫染色,计算中和滴度。
- 感染性病毒滴度的空斑测定:用空斑测定法检测肺匀浆中的 SARS-CoV-2 病毒滴度。将肺匀浆倍比稀释后接种到 Vero E6 细胞(针对 WA1 和 alpha 变异株)或 Vero TMPRSS2 细胞(针对 delta 和 omicron 变异株)上,培养后固定、染色,计数空斑,计算病毒滴度。
- 定量 PCR:用 RT-qPCR 检测 SARS-CoV-2 病毒 RNA 水平。将肺匀浆与 TRIzol 混合灭活病毒,提取 RNA 后进行 qRT-PCR,根据标准曲线计算病毒载量。
- 统计分析:使用 Prism 9.3.1 软件进行统计分析。ELISA、中和抗体和 RT-qPCR 实验通过非参数 Kruskal-Wallis 多重比较,比较疫苗组与载体对照、PBS 和 / 或 mRNA 加强组的差异;体重变化图通过 Mann-Whitney 检验比较各疫苗组与 PBS 组在每个时间点的差异。实验动物随机分组,未进行盲法处理,所有数据均纳入分析。
研究结果
- PIV5 载体 SARS-CoV-2 疫苗的构建和表征:构建了表达不同 SARS-CoV-2 抗原的 PIV5 载体疫苗,包括表达 S 蛋白的 CVXGA1、CVXGA3、CVXGA5、CVXGA13、CVXGA14,以及同时表达 S 和 N 蛋白的 CVXGA2。通过免疫荧光测定证实了插入的 S 和 / 或 N 抗原在 Vero 细胞中的表达。
- PIV5 载体 SARS-CoV-2 疫苗在地鼠中诱导抗 S 体液反应:单剂鼻内免疫金黄地鼠后,PIV5 载体免疫的地鼠在 28 天未检测到抗 SARS-CoV-2 S 结合抗体,而 CVXGA1、CVXGA2、CVXGA3 免疫的地鼠诱导的 ELISA 抗体滴度均值大于 16,125,CVXGA5 在较低免疫剂量下诱导的抗 S ELISA 滴度大于 9,870。
- CVXGA 疫苗保护地鼠免受同源和异源攻击:用 SARS-CoV-2 WA1 或 alpha 变异株攻击免疫后的地鼠,PIV5 载体免疫的地鼠体重下降且未恢复,而 CVXGA1、CVXGA2、CVXGA3、CVXGA5 免疫的地鼠体重下降后在 3 - 4 天恢复到感染前水平。在两种病毒攻击组中,CVXGA2 免疫的地鼠体重增加最多。通过检测肺组织中的病毒载量发现,CVXGA1、CVXGA2、CVXGA3、CVXGA5 免疫的地鼠在攻击后未检测到感染性病毒,且病毒 RNA 水平显著低于 PIV5 载体免疫的地鼠,表明 CVXGA 疫苗能有效保护地鼠免受同源和异源病毒攻击。
- CVXGA 疫苗保护地鼠免受 delta 变异株攻击:研究 CVXGA1、CVXGA3 和 CVXGA13 对 delta 变异株的免疫原性和功效。免疫后,三种疫苗均诱导出高水平的抗 S IgG 抗体,其中 CVXGA13 诱导的抗 WA1 RBD 抗体水平最高。攻击 delta 变异株后,CVXGA1、CVXGA3、CVXGA13 免疫的地鼠体重增加,而 PBS 免疫的地鼠体重下降。CVXGA13 免疫的地鼠体重增加最多,且三种疫苗免疫的地鼠肺匀浆中均未检测到感染性病毒,表明单剂鼻内免疫 CVXGA1、CVXGA3 和 CVXGA13 能保护地鼠免受同源和异源 delta 变异株攻击,且 CVXGA13 对同源 delta 病毒的保护效果最佳。
- CVXGA1 产生更持久的免疫力:比较 1 次(1× CVXGA1)和 2 次(2× CVXGA1)鼻内接种 CVXGA1 与 2 次肌肉注射 mRNA COVID - 19 疫苗(2× mRNA)的免疫效果。2× mRNA 免疫的地鼠在早期抗 S ELISA 抗体滴度较高,但 2× CVXGA1 免疫的地鼠在 108 天产生更高水平的抗 WA1 中和抗体。随着时间推移,2× mRNA 免疫的地鼠抗体滴度下降明显,部分地鼠检测不到针对 WA1、delta 和 omicron 变异株的中和抗体,而 2× CVXGA1 免疫的地鼠抗体维持较好。攻击 delta 变异株后,2× CVXGA1 免疫的地鼠体重增加显著,且肺组织中的病毒 RNA 水平低于 2× mRNA 免疫的地鼠,表明 CVXGA1 免疫的动物具有更持久的免疫力。
- 用 CVXGA 加强免疫可提高 mRNA COVID - 19 疫苗免疫地鼠的保护效果:以 2× mRNA 免疫为基础,用 CVXGA1、CVXGA13 和 CVXGA14 作为加强疫苗。加强免疫后,CVXGA 加强组的抗 S IgG 滴度更高,中和抗体水平显著高于 mRNA 加强组和未加强组。攻击 delta 变异株后,CVXGA14 或 CVXGA1 加强免疫的地鼠体重增加最佳,且所有加强免疫组的肺匀浆中均未检测到感染性病毒,但 CVXGA 加强组的病毒 RNA 水平最低,表明 CVXGA 作为加强疫苗可显著提高对变异株的保护效果。
讨论
CVXGA1 鼻喷式疫苗已在小鼠和雪貂中证明对 SARS-CoV-2 WA1 有效,但 WA1 已不再全球流行,评估疫苗对 VOCs 的免疫效果至关重要。本研究虽未对 omicron 进行攻击实验,但通过测量 omicron 特异性交叉中和抗体,证明单剂 CVXGA1 可保护地鼠免受同源 WA1 和异源 alpha、delta 病毒攻击,且 CVXGA2 因表达 S 和 N 抗原提供了更强的保护。
美国约 81% 的人口已接种 COVID-19 疫苗,但现有疫苗对变异株效力降低。本研究表明,用 CVXGA1 加强免疫 2× mRNA 免疫的地鼠,可显著提高抗 WA1 S 抗体水平和针对 WA1、delta、omicron 变异株的中和抗体滴度,优于 mRNA 加强免疫,说明 CVXGA1 可增强已接种个体对 VOCs 的免疫力。
由于免疫逃逸增加,更新 COVID-19 疫苗以应对当前流行的 VOCs 很有必要。本研究还评估了表达不同变异株 S 蛋白的 PIV5 载体疫苗的免疫原性和保护效果,发现接种 PIV5 载体 delta 变异株 S 蛋白(CVXGA13)的地鼠在攻击 delta 变异株后体重增加最多,且用 PIV5 载体 delta 或 omicron S 蛋白加强免疫可显著提高中和抗体水平,表明 PIV5 载体疫苗可作为针对 VOCs 的加强疫苗。
本研究存在局限性,未在地鼠模型中研究黏膜和细胞免疫,因相关试剂有限且数据不可靠。但在非人类灵长类(NHP)模型中已证明 CVXGA1 可在上呼吸道和下呼吸道提供显著保护,并诱导细胞和黏膜免疫。
此外,针对病毒载体疫苗存在的预存载体特异性免疫问题,先前研究表明约 30% 的人类对 PIV5 呈血清阳性,但 PIV5 载体疫苗可克服犬的预存抗 PIV5 免疫力。本研究中,CVXGA1 在仓鼠模型中展现出良好的保护和加强免疫效果,其在人体中的效果正在临床试验中评估。
目前已有多种鼻喷式 COVID-19 疫苗在临床或临床前研究中,部分鼻喷式疫苗的免疫原性优于肌肉注射。印度批准的腺病毒载体疫苗 iNCOVACC、中国批准的腺病毒载体疫苗康希诺(Convidecia)和流感病毒载体疫苗 dNS1-RBD,为鼻喷式疫苗平台带来了希望。
总之,正在美国进行人体临床试验评估的鼻喷式疫苗 CVXGA1,无论是对未免疫还是已接种 mRNA 疫苗的地鼠,单剂即可有效保护其免受同源和异源 SARS-CoV-2 变异株的攻击。研究数据表明,CVXGA1 及其他 PIV5 载体 COVID-19 疫苗可作为有效的异源加强疫苗,为已接种 COVID-19 mRNA 疫苗的个体提供持久的交叉反应免疫力。