研究成果 | 周岳课题组在STAR Protocols发表捕获拟南芥全基因组染色质相互作用的实验方案

　　

染色质的三维结构对于真核生物基因组稳定性与基因表达调控有着重要作用。近年来，随着高通量染色质构象捕获技术（Hi-C）等前沿技术的突破性发展，植物全基因组染色质相互作用的研究取得了显著进展。这些研究不仅揭示了植物染色质在细胞核内的空间排布规律，更为解析植物响应环境胁迫的表观遗传调控机制、发育程序的时空特异性调控网络提供了全新的研究视角。

2025年3月16日，基因功能研究与操控全国重点实验室、北京大学现代农学院、北京大学-清华大学生命科学联合中心周岳课题组受邀在Cell Press旗下学术期刊STAR Protocols杂志在线发表题为“Protocol for capturing genome-wide chromatin interactions in Arabidopsis”的实验方案类文章。文章详细介绍了捕获拟南芥全基因组染色质相互作用的实验方案。

该方案以拟南芥为实验材料，详细介绍了交联固定、细胞核分离、染色质酶切和连接、解交联和DNA提取、DNA片段化并分选、生物素富集和文库构建等步骤。周岳团队已运用本方案进行了拟南芥染色质三维结构的多角度研究，相关研究成果已发表于Molecular Cell、Plant Cell、Genome Biology等多个期刊。此外，该方案目前已被证实在大豆、小麦、玉米等作物的染色质三维结构研究中同样可行。

基因功能研究与操控全国重点实验室、北京大学现代农学院、北京大学-清华大学生命科学联合中心周岳研究员为本文通讯作者，北京大学前沿交叉学科研究院博士生舒家悦为本文第一作者。该研究得到科技创新2030重大项目、国家自然科学基金、中国科学院青年交叉团队、基因功能研究与操控全国重点实验室、北京大学现代农学院、北京大学-清华大学生命科学联合中心的资助。