重大发现!N4- 乙酰胞苷修饰 ITGB5 mRNA 或成胰腺癌治疗新靶点

【字体: 时间:2025年03月23日 来源:Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 11.4

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  胰腺癌(PDAC)的神经浸润(PNI)机制不明,严重影响患者预后。研究人员针对此开展 N4- 乙酰胞苷(ac4C)修饰在 PDAC 中作用的研究。结果发现 N - 乙酰转移酶 10(NAT10)通过 ac4C 修饰 ITGB5 促进 PNI,联合抑制 NAT10 和黏着斑激酶(FAK)可减弱 PNI,为 PDAC 治疗提供新策略。

  胰腺癌,这个被称为 “癌中之王” 的恶性肿瘤,一直让医学界头疼不已。胰腺癌的 5 年总生存率仅有 13%,超半数患者确诊时已处于局部晚期无法手术,这主要是因为它极易侵犯周围组织,而神经浸润(PNI)就是其显著特征之一,几乎 100% 的胰腺癌患者都存在 PNI,可它的具体发生机制却一直是个谜。RNA 修饰作为新兴研究领域,在肿瘤研究中展现出巨大潜力,多种 RNA 修饰与肿瘤的发生、发展密切相关。然而,在胰腺癌 PNI 方面,RNA 修饰的作用却鲜为人知。为了揭开这个谜团,探寻治疗胰腺癌的新方法,广东省人民医院、中山大学孙逸仙纪念医院等机构的研究人员开展了深入研究。
研究人员从 2008 年 1 月至 2020 年 7 月在中山大学孙逸仙纪念医院(SYSMH)、2014 年 1 月至 2024 年 7 月在广东省人民医院(GDPH)收集胰腺癌及癌旁组织样本。通过超高效液相色谱 / 质谱 - 质谱(UPLC/MS - MS)技术,在 55 种 RNA 修饰中发现,与无 PNI 的胰腺癌组织相比,有 PNI 的组织中 N4- 乙酰胞苷(ac4C)修饰显著改变 。ac4C 是一种乙酰化核苷,此前在多种肿瘤进展中发挥作用,但在胰腺癌 PNI 中的角色尚未明确。

研究人员进一步发现,N - 乙酰转移酶 10(NAT10)作为 mRNA ac4C 修饰的唯一已知 “书写者”,其在胰腺癌组织中的表达与 ac4C 修饰水平呈正相关。高表达 NAT10 的患者总生存期(OS)、无病生存期(DFS)和无进展生存期(PFS)更差。通过细胞实验和动物模型实验,研究人员沉默 NAT10 表达后,发现胰腺癌细胞的迁移、侵袭和 PNI 能力均受到抑制 。

在机制研究方面,研究人员运用 acRIP-seq、ac4C-seq 和 RNA-seq 等技术,发现 NAT10 通过 ac4C 修饰调节黏着斑通路。在众多潜在靶点中,整合素 β5(ITGB5)脱颖而出,它是黏着斑通路中的关键受体。NAT10 介导的 ac4C 修饰位于 ITGB5 mRNA 的编码区(CDS),可增强其稳定性。当 NAT10 表达被抑制时,ITGB5 mRNA 的 ac4C 修饰减少,导致其降解加快,蛋白表达降低 。

功能验证实验表明,过表达 NAT10 野生型(NAT10WT)可增强胰腺癌细胞的迁移、侵袭和转移能力,而过表达催化失活的 NAT10 突变体(NAT10G641E)则无此效果。进一步研究发现,ITGB5 可挽救因 NAT10 敲低而受损的细胞功能,促进肿瘤细胞向背根神经节(DRG)的侵袭和肺转移 。

基于以上发现,研究人员尝试寻找潜在的治疗策略。他们使用 NAT10 的小分子抑制剂 Remodelin(Rem)和 FAK 抑制剂 Defactinib(DFN)进行联合治疗。体外实验和体内实验结果显示,联合治疗可显著抑制肿瘤细胞的侵袭和 PNI,为胰腺癌治疗提供了新的方向。

该项研究发表在《Journal of Experimental & Clinical Cancer Research》上。此次研究主要运用了以下关键技术方法:一是样本收集与处理,收集来自 SYSMH 和 GDPH 两个队列的临床样本;二是采用 UPLC/MS-MS 技术分析 RNA 修饰;三是运用 RNA 免疫沉淀测序(acRIP-seq)、ac4C 测序(ac4C-seq)和 RNA 测序(RNA-seq)探究修饰机制;四是构建细胞模型和动物模型验证功能 。

研究结果如下:

  1. ac4C 修饰和 NAT10 水平在胰腺癌 PNI 中升高:UPLC/MS-MS 分析发现,有 PNI 的胰腺癌组织中 ac4C 修饰上调,RNA dot blot assays 进一步证实了这一点。同时,分析公共数据库及两个独立队列发现,NAT10 在恶性细胞中高表达,与胰腺癌风险增加及不良预后相关 。
  2. NAT10 敲低损害胰腺癌肿瘤迁移、侵袭和 PNI:在胰腺癌细胞系中沉默 NAT10 表达,Transwell 实验表明细胞迁移和侵袭能力减弱。与 DRG 共培养及小鼠坐骨神经模型实验显示,NAT10 敲低显著抑制 PNI 。
  3. NAT10 在胰腺癌中的表达以 ac4C 依赖的方式调节黏着斑:NAT10 敲低降低了 ac4C mRNA 水平,测序分析发现 ac4C 位点主要位于 CDS 区域的经典共识 CXXCXX 基序内。KEGG 富集分析表明,NAT10 敲低影响黏着斑通路,抑制 FAK(Tyr397)和 Src(Tyr416)磷酸化 。
  4. ITGB5 是胰腺癌 ac4C 修饰的下游靶点:RNA-seq 和基因富集分析(GSEA)表明,NAT10 调节黏着斑通路。通过重叠 acRIP-seq 和 ac4C-seq 数据,结合 RNA-seq 数据,确定 ITGB5 为关键靶点。acRIP 实验验证了 ITGB5 的 ac4C 修饰受 NAT10 调控 。
  5. NAT10 介导的 ITGB5 的 ac4C 修饰促进胰腺癌细胞的迁移、侵袭和转移:过表达 NAT10WT增强细胞迁移和侵袭能力,ITGB5 过表达可挽救因 NAT10 敲低而受损的细胞功能,促进肿瘤细胞向 DRG 的侵袭和肺转移 。
  6. NAT10-ITGB5 - 黏着斑轴促进胰腺癌 PNI:Rem 和 DFN 联合治疗可显著抑制肿瘤细胞侵袭和 PNI。在人胰腺癌样本中,高 NAT10 表达的患者,ITGB5 表达与肿瘤侵袭表型正相关 。

研究结论和讨论部分指出,NAT10 通过介导 ac4C 修饰 ITGB5,激活 ITGB5-pFAK-pSrc 轴,促进胰腺癌 PNI 的发展。这一发现揭示了 ac4C 修饰在 PNI 中的重要作用,为预防 PNI 和改善胰腺癌患者预后提供了潜在的治疗靶点。然而,该研究也存在一定局限性,如目前尚未发现 ac4C 修饰的 “擦除器” 或 “阅读器”,研究主要基于细胞系和两个患者队列,体内模型也有待进一步完善。未来需要进一步探索 ac4C 修饰的调控机制,开发更有效的治疗策略,推动胰腺癌治疗的发展。
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