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为探究视网膜母细胞瘤（RB）间变和侧别相关基因表达差异，研究人员分析数据，发现二者影响基因表达，或关联临床症状。
视网膜母细胞瘤（Retinoblastoma，RB）是一种主要发生于婴幼儿的眼部恶性肿瘤，全球发病率在 1/20,000 至 1/15,000 之间，死亡率较高。间变程度和侧别（单侧或双侧）对 RB 患者的预后和生存率影响重大。单侧 RB 患者长期生存率相对较高，而间变程度越严重，患者临床结局往往越差。
目前，虽然已有研究涉及 RB 的基因表达，但都存在一定局限性。有的未研究不同间变等级肿瘤的基因表达差异，有的未基于侧别对样本基因表达进行分析。为了更全面深入地了解 RB 基因表达特征与临床发展的关联，华中科技大学同济医学院附属协和医院眼科的研究人员开展了相关研究。该研究成果发表在《Scientific Reports》上，对揭示 RB 的发病机制和指导临床治疗具有重要意义。
研究人员从美国国立生物技术信息中心（NCBI）的基因表达综合数据库（GEO）中选取了两个数据集（GSE141209 和 GSE110811），其中包含 36 例 RB 患者肿瘤组织的基因芯片数据。研究用到的主要关键技术方法包括：利用 R（版本 4.0.3）和 Bioconductor（版本 3.12）软件对基因芯片数据进行统计分析，用 RMA（Bioconductor Version 3.1.2）处理原始微阵列文件，Limma 分析表达差异；通过基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA，版本 4.1.0）探究基因功能富集情况，用调整后的 P 值和绝对倍数变化对基因进行筛选和排序 。
研究结果如下：
- GSE141209 数据集间变相关分析：根据间变等级对 GSE141209 数据集重新分组，对比严重间变组和无间变组的基因表达。在表达变化最大的 500 个基因中，83 个基因满足 P 值≤0.05 且变化倍数大于 1.5（log2）。功能富集分析显示，LRIT3、USH2A 等基因在感觉知觉功能上存在显著富集，且在严重间变患者肿瘤组织中显著下调，这些基因常与眼部疾病密切相关。
- GSE110811 数据集侧别对基因表达的影响：将 GSE110811 数据集中 13 例中度间变患者样本分为单侧和双侧疾病组进行分析。在表达变化最大的 1000 个基因中，95 个基因符合筛选标准。单侧样本中，影响眼球共轭运动和脂质代谢功能的基因表达增强；双侧样本中，抑制细胞增殖功能的基因表达增强。
- GSE110811 数据集单侧样本间变对基因表达的影响：把 GSE110811 数据集中 17 例单侧样本分为严重间变组和中度间变组。在表达变化最大的 1000 个基因里，282 个基因满足条件。严重间变组中，与感觉知觉和光感知相关的基因表达显著降低，且两个公共数据集都显示 RGS9 基因在严重间变组中表达明显下降。
- GSE110811 数据集双侧样本间变对基因表达的影响：GSE110811 数据集中有 9 例双侧样本，分析发现，在表达变化最大的 1000 个基因中，80 个基因符合条件，但未发现与视觉相关的功能富集。
研究结论和讨论部分指出，不同间变程度和侧别在 RB 发病机制中，与不同的视觉相关肿瘤基因特征有关。这表明存在与间变和侧别相关的独特功能基因特征，它们可能共同影响 RB 的临床发展。不过，当前研究样本量有限，结论的稳健性受到一定影响。未来需要更大样本量的公共数据和内部队列研究，进一步明确这些遗传差异对 RB 诊断和治疗策略的全面影响。同时，在收集自有样本和设计实验时，应注意避免间变和侧别因素的相互干扰。该研究为后续深入研究 RB 提供了重要线索，有助于推动 RB 精准诊疗的发展。
