发现新型融合基因!拓宽胃肠道间质瘤 NTRK 重排遗传谱

【字体: 时间:2025年03月26日 来源:Diagnostic Pathology 2.4

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  胃肠道间质瘤(GISTs)中野生型(WT)的分子变化、预后及治疗存在不确定性。研究人员对一例四重野生型 GIST 病例展开研究,发现新的 CDC42BPB::NTRK3 融合,拓宽了 GISTs 中 NTRK 重排的遗传谱,为相关研究和治疗提供新思路。

  在人体的胃肠道中,存在着一种较为常见的间叶性肿瘤 —— 胃肠道间质瘤(Gastrointestinal stromal tumors,GISTs)。它的发病率大约在每年 1.1 - 1.8/100,000 。多数 GISTs 带有 KIT(80%)或 PDGFRA(10%)突变 ,然而那些缺乏 KIT 或 PDGFRA 突变的则被定义为野生型(WT)GISTs 。其中,四重野生型 GISTs 更是只占所有 GISTs 的 5% 。目前,WT GISTs 的分子变化、预后情况以及治疗方案都还不明确,尤其是 WT GISTs 中神经生长因子受体酪氨酸激酶(Neurotrophic tyrosine receptor kinase,NTRK)融合的相关研究较少,这就像在黑暗中摸索,充满了未知。为了进一步探究这些未知,复旦大学附属中山医院的研究人员展开了一项研究。
研究人员报道了一例带有新型 CDC42BPB::NTRK3 融合的四重野生型 GIST 病例,这一发现拓宽了 GISTs 中 NTRK 重排的遗传谱。该研究成果发表在《Diagnostic Pathology》上,为该领域的研究提供了新的方向和重要依据。

在研究过程中,研究人员主要运用了下一代测序(Next-generation sequencing,NGS)、荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)和免疫组化(Immunohistochemistry,IHC)技术。通过对一名 66 岁男性患者的肿瘤样本进行检测,首先利用 NGS 技术对相关基因进行检测,之后使用 FISH 技术对 NGS 检测出的 NTRK3 基因重排结果进行验证,最后通过 IHC 检测肿瘤组织中 Trk 蛋白的表达情况。

在病例呈现方面:一位 66 岁男性患者因黑便入院,腹部 CT 扫描显示左下腹空肠内有病变 。术后病理显示肿瘤细胞呈梭形,伴有大量淋巴细胞和浆细胞浸润,局部淋巴细胞形成三级淋巴滤泡,肿瘤浸润固有肌层,形态类似炎性肌纤维母细胞瘤(Inflammatory myofibroblastic tumor,IMT)。但免疫组化结果显示,肿瘤细胞 ALK 阴性、α - SMA 局灶阳性,可排除 IMT 诊断;同时,肿瘤细胞 CD117、DOG - 1 和 CD34 弥漫性阳性,结合病理有丝分裂象难以找到,根据美国国立卫生研究院(National Institute of Health,NIH)标准,诊断为低风险 GIST。基因检测方面,首次 NGS 检测未发现明确突变,再次使用 2000 - 基因 panel 进行 NGS 检测,发现 CDC42BPBexon24 - NTRK3exon15基因融合,FISH 分析进一步证实了 NTRK3 基因重排,但 IHC 未检测到肿瘤组织中 Trk 蛋白的表达。

在讨论环节,研究人员通过系统回顾文献,分析了 18 例 NTRK 突变的 GIST 病例(包括该研究病例),发现 NTRK 重排的 GISTs 可发生在消化道各部位,患者以男性居多,NTRK3 突变最为常见,其中 ETV6::NTRK3 是最常见的 NTRK3 重排组合。在检测 NTRK 重排时,不同检测方法各有优劣。IHC 虽经济方便,但对 NTRK3 融合的检测灵敏度较低;FISH 可检测未知融合伴侣的 NTRK 重排,但存在检测费用高、部分 NTRK1 改变难以区分正常与异常细胞等问题;欧洲肿瘤内科学会(ESMO)和中国临床肿瘤学会(CSCO)分别对不同 NTRK 融合频率的肿瘤推荐了相应的检测方法。此外,NTRK 基因融合可激活 Trk 蛋白表达促使肿瘤发展,Trk 抑制剂对 NTRK 重排肿瘤有一定疗效,WT GISTs 伴有 NTRK 融合可考虑使用 Trk 抑制剂治疗。然而,该研究也存在局限性,如受实验室条件限制,未能进一步通过 PCR 或融合探针验证 CDC42BPB::NTRK3 融合,且缺乏融合基因激酶活性数据以及 Trk 抑制剂对该融合产物激酶活性抑制效果的数据。

总的来说,该研究发现了一例四重野生型 GIST 伴有 CDC42BPB::NTRK3 融合,拓宽了 GISTs 中 NTRK 重排的遗传谱,强调了在野生型 GISTs 中检测 NTRK 基因重排的必要性,为后续研究和临床治疗提供了重要参考。虽然研究存在一些局限性,但也为未来的研究指明了方向,激励着科研人员进一步探索 WT GISTs 的奥秘,寻找更有效的治疗方法,改善患者的预后。
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