综述:DNA 末端切除在 DNA 双链断裂(DSB)修复中的作用

【字体: 时间:2025年03月26日 来源:Nature Reviews Molecular Cell Biology

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  该综述聚焦 DNA 末端切除在 DSB 修复中的作用,阐述其机制、调控及对修复通路的影响。

  DNA 双链断裂(Double-Strand Break,DSB)是一种严重的 DNA 损伤形式,会威胁基因组的稳定性,进而影响细胞的正常功能和机体健康。在众多 DSB 修复途径中,DNA 末端切除(DNA end resection)是至关重要的起始步骤。

DNA 末端切除的基本过程


DNA 末端切除指的是在 DSB 位点,核酸酶对 5′端进行核溶解降解,从而产生 3′单链 DNA 突出端(3′ single-stranded DNA overhangs)。这一过程可分为两个阶段。首先是短程切除,由核酸酶 MRE11 作为 MRE11–RAD50–NBS1(MRN)复合物的一部分催化完成。MRE11 具有核酸内切酶和 3′ - 5′ 外切酶活性,能在 DSB 附近切割 DNA 双链,初步产生较短的 3′单链 DNA。之后进入长程切除阶段,主要由核酸酶 EXO1 和 / 或 DNA2 发挥作用。EXO1 是一种 5′ - 3′ 外切酶,可沿着 DNA 链持续切割,扩大单链区域;DNA2 则兼具内切酶和 5′ - 3′ 外切酶活性,与解旋酶相互协作,高效地进行长距离的末端切除。

DNA 末端切除在 DSB 修复途径中的重要性


  1. 同源重组(Homologous Recombination,HR):切除产生的单链 DNA 对于 HR 至关重要。在 HR 过程中,单链 DNA 会进行同源搜索,寻找与之互补的同源序列。一旦找到,便会引发 DNA 合成,修复断裂的双链。这一过程高度精确,能够准确恢复受损 DNA 的序列,维持基因组的稳定性。
  2. 微同源介导末端连接(Microhomology-Mediated End-Joining,MMEJ)和单链退火(Single-Strand Annealing,SSA):DNA 突出端在 MMEJ 和 SSA 途径中发挥着关键作用。在 MMEJ 中,DNA 末端切除暴露出微同源序列,这些短的同源区域可介导断裂末端的退火和连接;SSA 则依赖于单链 DNA 的退火,通过切除产生的互补单链区域相互配对,实现修复。
  3. 非同源末端连接(Non-Homologous End-Joining,NHEJ):与上述修复途径不同,DNA 末端切除对 NHEJ 起到抑制作用。NHEJ 是一种不依赖同源序列的修复方式,直接将断裂的 DNA 末端连接起来。而末端切除会破坏 DNA 末端的结构,使 NHEJ 难以进行,这也表明细胞在选择修复途径时,DNA 末端切除起到了关键的调控作用。

DNA 末端切除的调控机制


  1. 磷酸化修饰:磷酸化是调控 DNA 末端切除的重要方式之一。在细胞周期的不同阶段以及应对 DNA 损伤时,多种蛋白激酶会对参与末端切除的关键蛋白进行磷酸化修饰。例如,ATM(Ataxia Telangiectasia Mutated)激酶在 DNA 损伤发生后被激活,它可以磷酸化 MRN 复合物中的 NBS1,增强 MRN 复合物的活性,促进短程切除的起始。此外,ATR(Ataxia Telangiectasia and Rad3-Related)激酶也能参与调控,在复制应激等情况下,对相关蛋白进行磷酸化,精细调节末端切除的进程。
  2. 其他翻译后修饰:除了磷酸化,还有其他翻译后修饰参与调控 DNA 末端切除。泛素化修饰可以影响参与末端切除蛋白的稳定性和定位。例如,某些 E3 泛素连接酶可以将泛素连接到核酸酶上,调节其在细胞内的水平,进而影响末端切除的效率。SUMO 化修饰则可以改变蛋白之间的相互作用,影响 MRN 复合物以及其他相关蛋白在 DSB 位点的聚集和功能发挥。

总结与展望


DNA 末端切除在 DSB 修复中处于核心地位,它通过多种机制影响着不同的修复途径,确保细胞能够根据自身的状态和损伤情况选择合适的修复方式。翻译后修饰对 DNA 末端切除的调控精细而复杂,保证了这一过程在细胞周期和 DNA 损伤应答中的准确进行。然而,目前仍有许多问题有待进一步研究。例如,不同翻译后修饰之间的协同作用机制尚未完全明确;在特定疾病状态下,DNA 末端切除的异常调控与疾病发生发展的具体关联还需要深入探究。未来,随着研究技术的不断进步,对 DNA 末端切除的理解将更加深入,这也将为开发针对相关疾病的治疗策略提供新的思路和靶点。例如,针对肿瘤细胞中异常活跃的 DNA 末端切除,可以设计特异性的抑制剂,阻断肿瘤细胞的 DNA 修复,提高放疗和化疗的效果;对于一些因 DNA 修复缺陷导致的遗传性疾病,也有望通过调节 DNA 末端切除来探索新的治疗方法。
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