从海洋硅藻藻际环境中获取高质量宏基因组组装基因组（MAGs）及其在研究硅藻 - 微生物相互作用中的意义

为探究硅藻（Skeletonema）与其藻际微生物群之间的相互作用，研究人员从长期在人工海水中培养的海洋硅藻热带骨条藻（Skeletonema tropicum）的藻际环境中回收宏基因组组装基因组（MAGs）。结果获得多数高质量 MAGs，这为相关研究提供了参考基因组。

　　从长期在人工海水中培养的海洋硅藻热带骨条藻（Skeletonema tropicum）的藻际环境中，成功回收了宏基因组组装基因组（MAGs）。大多数 MAGs 完整性极高（超过 90%），污染极少（低于 5%），可作为参考基因组，用于深入研究骨条藻与其藻际微生物群之间的相互作用。海洋中硅藻与细菌的相互作用已持续超 2 亿年，形成了复杂关系，促进了营养物质交换和生物地球化学循环。此次研究从实验室长期培养的热带骨条藻混合宏基因组测序中，获得 24 个高质量和 2 个中等质量的 MAGs。研究人员对提取的 DNA 进行 Illumina 和 QitanTech Nanopore 测序，得到短读长和长读长数据。经过一系列复杂的生物信息学分析流程，包括序列修剪、组装、分箱、注释等，最终确定了 26 个 MAGs 的相关信息。这些 MAGs 分属于 5 个细菌门，其完整性、污染程度和分类学信息也已明确。这些 MAGs 的获得，有助于推动海洋中硅藻 - 细菌相互作用的研究。