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为解决从血清阴性未分化关节炎(UA)预测类风湿关节炎(RA)进展的难题,研究人员开展了基于机器学习构建预测模型的研究。结果显示,FNN 模型在预测 RA 进展上表现出色,为临床预测提供了新工具。
类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)是一种令人 “谈之色变” 的疾病,它就像隐藏在关节中的 “小恶魔”,不仅会引发关节炎症,还可能带来各种关节外症状。如果不能及时发现并治疗,患者会承受巨大痛苦,甚至面临残疾风险。早期诊断和治疗对 RA 患者至关重要,然而现有的美国风湿病学会(ACR)/ 欧洲抗风湿病联盟(EULAR)2010 年 RA 分类标准却存在局限性,许多早期炎症性关节炎患者并不符合该标准,其中血清阴性未分化关节炎(Undifferentiated Arthritis,UA)患者的诊断和疾病进展预测更是难题。因为约 50% 的 UA 病例会自行缓解,约 30% 会发展为 RA,且血清阴性 RA 常因不符合分类标准而被误诊。在这样的背景下,来自京都大学等机构的研究人员开展了一项研究,致力于构建一个能预测血清阴性 UA 进展为 RA 的机器学习(Machine Learning,ML)模型。该研究成果发表在《Arthritis Research & Therapy》上。
为开展此项研究,研究人员主要采用了以下关键技术方法:利用 KURAMA 队列作为训练数据集,ANSWER 队列作为验证数据集;收集患者临床和实验室参数,包括人口统计学数据、急性期反应物、自身抗体等;运用多种统计分析方法和 ML 模型构建技术,如使用 Scipy、Scikit-learn 等工具进行分析,用 Tensorflow 和 Keras 构建前馈神经网络(Feedforward Neural Network,FNN)模型,通过 5 折交叉验证评估模型性能,并计算 SHapley Additive exPlanations(SHAP)值解释变量重要性。
研究结果如下:
- 患者特征:在 KURAMA 队列中分析了 210 例血清阴性 UA 患者,其中 57 例(27.1%)进展为 RA。与未进展为 RA 的患者相比,进展为 RA 的患者年龄更大,且 CRP、ESR、MMP-3、PhGA、PtGA、TJC、SJC 和 HAQ-DI 等指标更高。在 ANSWER 队列中,140 例血清阴性 UA 患者里有 45 例(32.1%)进展为 RA,同样发现 RA 进展者和非进展者在 CRP、ESR、MMP-3、PhGA 和 HAQ-DI 等方面存在显著差异。
- 机器学习模型预测 RA 进展:研究对比了多种 ML 模型,发现加入 MMP-3 可提升非深度学习模型性能。FNN 模型表现最为突出,在 KURAMA 训练队列中,其准确率达 87.8%,AUC 为 0.924,敏感度为 70.6%,PPV 为 75.1%,F1 评分为 0.720 。将阈值设为 0.4 后,敏感度提升至 80.7%。
- 变量对模型的影响:通过计算 SHAP 值,发现 MMP-3 对 FNN 模型影响最大,其次是 PhGA、PtGA、BMI 和年龄,且这些特征值越高,模型对 RA 进展的预测越强。
- 模型外部数据验证:用 ANSWER 队列验证 FNN 模型,其 AUC 为 0.777,虽在验证队列中准确率、特异性和 PPV 有所下降,但仍保持了合理的敏感度和 AUC ,说明模型具有一定的泛化能力和临床应用潜力。
研究结论和讨论部分指出,FNN 模型在预测血清阴性 UA 进展为 RA 方面表现出良好性能,且在独立验证队列中保持了较高敏感度,为预测 RA 进展提供了新的非侵入性工具。不过,该研究也存在局限性,如样本主要为亚洲人群,样本量相对较小,可能存在过拟合风险,随访时间可能未完全涵盖 UA 到 RA 的长期进展,诊断血清阴性 RA 也存在挑战等。尽管如此,这项研究依然意义重大,它为临床医生预测血清阴性 UA 患者的疾病进展提供了有力支持,有望通过检测血液 MMP-3 水平并结合该模型,改善患者的治疗效果,为 RA 的早期诊断和治疗开辟新的道路。