基于长读长测序数据的基因组组装评估利器 ——Inspector 详解：开拓精准评估新视野

为解决长读长测序数据基因组组装评估难题，研究人员开展关于评估工具 Inspector 的研究。结果显示，Inspector 具备多种优势，可精准评估组装情况。这为长读长组装评估提供了有力框架，推动相关研究发展。

　　长读长测序技术（Long-read sequencing technologies）能产生较长的 DNA 序列，可跨越复杂、重复的基因组区域，有助于生成更精确、全面的基因组组装（genome assembly）。然而，由于基因组固有的复杂性、测序技术和组装算法的局限性，组装错误难以避免，因此组装评估至关重要。基因组组装评估工具 Inspector 相比现有的长读长从头组装评估工具具有诸多优势，包括：（1）可进行无参考和有参考引导的组装评估；（2）能够检测小规模和大规模的结构错误；（3）可选择对组装错误进行纠正，提高原始组装的质量值；（4）具备单倍型解析组装评估的能力 。Inspector 不仅能提供基本的重叠群（contig）和比对统计信息，还能精确指出不同结构错误的位置和类型。这些优势为长读长组装评估提供了强大的框架。在本实验方案中，展示了四个步骤，以说明 Inspector 在长读长组装评估中的不同应用。Inspector 软件及更多指南可在https://github.com/ChongLab/Inspector_protocol获取。