西班牙阿尔布费拉湖中创伤弧菌的基因组特征：气候变暖背景下的生态与公共卫生风险

推荐语：随着全球变暖加剧，创伤弧菌（Vibrio vulnificus, Vv）的分布范围正从传统温暖水域向温带扩张。来自西班牙瓦伦西亚大学的研究团队对阿尔布费拉湖生态系统中13株Vv进行了全基因组测序，揭示了高温（30°C）环境下该病原体的基因组特征。研究采用PacBio和Illumina双平台测序，结合vvhA基因鉴定，为气候变化驱动的病原体扩散提供了关键分子证据，对水产养殖安全和公共卫生防控具有重要警示意义。

　　在西班牙瓦伦西亚南部的阿尔布费拉自然公园，一项关于创伤弧菌（Vibrio vulnificus, Vv）的前沿研究正在改写人们对这种嗜盐病原体的认知。2022至2023年夏季，当湖水温度飙升至罕见的30°C时，科研团队从湖泊、通海航道（Pujol和Perellonet）及邻近海滩四个位点捕获了13株Vv菌株。这些革兰阴性菌不仅能在TSA-1培养基（含1% NaCl）上旺盛生长，更通过种属特异性基因vvhA的PCR扩增得到确证。

研究团队运用"双轨制"测序策略：对Alb1、Per1等三株菌采用PacBio Sequel IIe平台获取长读长数据（读长5-10 kb），其余菌株则通过Illumina MiSeq v3进行双端300 bp测序。经过MagAttract HMW DNA试剂盒提纯的高质量DNA，经Flye或Unicycler软件组装后，呈现出显著的基因组差异——PacBio组装的N50值高达3.3 Mb，而Illumina组装的contigs数量则多达224个。表1数据显示，这些5 Mb左右的基因组GC含量稳定在46.5%左右，编码约4500个基因，其中Permar1菌株的基因数量甚至达到4736个。

这项由ThinkInAzul计划资助的研究首次揭示：地中海半咸水生态系统中，Vv的基因组特征与水温异常升高存在潜在关联。当测序深度达到353×时（如Alb1菌株），研究者得以精确注释毒力因子相关基因，为解释该病原体引发鱼类和人类败血症（vibriosis）的分子机制奠定基础。这些保存在NCBI（登录号如GCA_038397025.1）的基因组资源，将成为监测气候变化下病原体进化的"分子雷达"。