澳大利亚肉鸡源弯曲菌的抗生素耐药性及基因组特征：2022年追踪调查与公共卫生启示

本研究针对澳大利亚肉鸡产业链中弯曲菌(Campylobacter)的抗生素耐药性(AMR)问题展开追踪调查。Murdoch大学团队通过表型药敏试验和全基因组测序(WGS)技术，分析了2022年采集的186株分离株（含123株C. jejuni和63株C. coli），发现尽管澳大利亚禁用氟喹诺酮类，但C. jejuni对环丙沙星的耐药率仍高达24.4%，且检测到gyrA-T86I突变等关键耐药基因。研究揭示了ST2083等优势序列型(ST)的持续流行，为理解耐药菌株在无选择压力下的持久性机制提供了重要证据，对完善食源性病原体监测体系具有指导价值。

　　在食源性疾病领域，弯曲菌感染始终是困扰全球公共卫生的难题。这种通过未煮熟禽肉传播的病原体，每年导致数亿人出现腹泻、发热等症状，严重时甚至引发吉兰-巴雷综合征等神经系统并发症。令人担忧的是，随着抗生素在畜牧业的广泛应用，弯曲菌对氟喹诺酮等"最高优先级重要抗菌药物"的耐药性持续攀升。然而澳大利亚的情况却显得扑朔迷离——这个严格禁止在食用动物中使用氟喹诺酮的国家，2016年首次在肉鸡中检出耐环丙沙星的弯曲菌株，这些菌株究竟如何获得耐药性？时隔六年，它们的流行态势是否发生变化？这些问题直接关系到抗生素管理政策的有效性评估。

为解答这些科学疑问，澳大利亚Murdoch大学Nikki Owiredu领衔的研究团队开展了全国性追踪调查。研究人员从代表95%产能的20家屠宰场采集200份盲肠样本（每份含5只鸡的混合样本），通过选择性培养获得186株弯曲菌分离株。采用CLSI标准化的微量肉汤稀释法检测11种抗生素的敏感性，同时运用Illumina平台进行全基因组测序，结合多位点序列分型(MLST)和单核苷酸多态性(SNP)分析解析种群结构。相关成果发表在《Scientific Reports》期刊。

研究结果显示，68.7%的C. jejuni和88.9%的C. coli对所有测试抗生素敏感，未发现多重耐药株。但值得注意的是，24.4%的C. jejuni呈现氟喹诺酮耐药性，显著高于C. coli的3.2%。基因组分析揭示这些耐药菌株携带gyrA基因QRDR区的特征性T86I突变。通过比较2016与2022年数据，发现环丙沙星耐药率虽略有上升（C. jejuni从14.8%增至24.4%），但统计学上无显著差异，提示耐药菌株在无药物选择压力下仍保持稳定传播。

在基因组特征部分，研究鉴定出32个C. jejuni ST型和13个C. coli ST型，包括4个新型C. jejuni ST和7个新型C. coli ST。耐药菌株主要集中于ST2083（含11株）、ST10130（4株）等特定克隆系，其中ST2083在2016年调查中已被发现，显示其持续存在达六年之久。核心基因组SNP分析显示，FQ-R菌株分散于不同进化分支，ST2398等新检出耐药克隆的出现暗示可能存在独立进化事件。C. coli种群则以ST827（28%）和ST825（25%）为主导，属于国际流行的CC828克隆复合体。

讨论部分着重探讨了三个关键发现：首先，尽管澳大利亚实施严格的抗生素使用限制，氟喹诺酮耐药率未见预期下降，可能与gyrA突变株在鸡肠道中的适应性优势有关；其次，ST2083等克隆在人类临床分离株中的报道暗示人-动物传播链存在的可能性；最后，检测到的bla_OXA系列β-内酰胺酶基因虽无直接临床意义，但提示需要建立更精准的耐药基因注释标准。作者建议加强从农场到餐桌的全链条监测，特别关注野生生物等潜在传播媒介。

这项研究首次系统描绘了澳大利亚肉鸡源弯曲菌耐药性的动态变化，为理解耐药性在无选择压力环境中的维持机制提供了重要案例。其发现不仅对完善澳大利亚的食源性疾病防控策略具有指导价值，也为其他国家制定抗生素管理政策提供了科学参考。持续监测这类"隐形"耐药菌的进化轨迹，将是保障食品安全和公共卫生的重要防线。