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本文通过潜在类别分析评估多种艰难梭菌(Clostridioides difficile,CD)诊断测试性能。艰难梭菌感染(CDI)诊断困难,核酸扩增测试(NAAT)特异性欠佳,酶免疫测定(EIA)敏感性低。研究发现新型 SIMOA 毒素 EIA 敏感性优于传统 EIA,对 CDI 诊断意义重大。
艰难梭菌感染诊断现状及研究背景
艰难梭菌(Clostridioides difficile,CD)是引发加拿大及全球医疗保健相关感染性腹泻的关键因素。准确、快速地诊断艰难梭菌感染(Clostridioides difficile infection,CDI),对及时治疗和防控传播极为重要。然而,当前 CDI 的诊断颇具挑战。
在众多检测方法中,细胞毒性中和试验(cell cytotoxicity neutralization assay,CCNA)虽与临床结果关联紧密,被视为 CDI 检测的优质选择,但它耗时久、标准化难度大,难以在临床实验室常规开展。核酸扩增测试(Nucleic acid amplification test,NAAT)常被用于检测粪便中的毒素 B 基因,以诊断 CDI,不过,由于存在 CD 无症状定植(CD asymptomatic colonization,CD-AC)的情况,其对 CDI 诊断的特异性并不理想。相反,检测 CD 毒素的酶免疫测定(enzyme immunoassay,EIA)虽特异性高,但敏感性较低,报道显示其敏感性仅在 33 - 65% 之间。
为应对这一难题,研究人员借助单分子阵列(single - molecule array,SIMOA)技术开发出新型定量检测 CD 毒素 A 和 B 的方法。该技术检测分析物的能力强大,能检测到极低含量的目标物质。初步数据表明,SIMOA CD 毒素 A 和 B 酶联免疫吸附试验的敏感性比传统定性 CD 毒素 EIA 提高了 1000 倍,检测限分别低至 0.45 和 1.5 pg/mL,而传统定性 CD 毒素 EIA 的检测限在 0.8 - 2.5 ng/mL。本研究旨在评估多种诊断方法对 CDI 的诊断性能,为临床诊断提供更可靠的依据。
材料与方法
- 研究对象招募:2018 年 3 月 15 日至 2020 年 8 月 31 日,加拿大魁北克省蒙特利尔市的两所大学附属医院(麦吉尔大学健康中心和犹太总医院)参与了此项研究。招募对象为 18 岁及以上、有粪便样本进行 CD 检测的患者。入选标准为 24 小时内至少出现三次水样便(布里斯托评分 5 - 7)且无其他明显病因。若患者有结肠造口术、接受过至少 24 小时针对 CDI 的特异性治疗或已参与过本研究,则被排除在外。虽未专门排除使用泻药的患者,但护士会避免提交此类患者的粪便样本进行 CD 分析。
- 样本检测方法:收集参与者的粪便标本后,分别采用 CCNA、产毒培养、谷氨酸脱氢酶(glutamate dehydrogenase,GDH)EIA、NAAT、传统 CD 毒素 A 和 B EIA 以及新型 SIMOA 毒素 A 和 B EIA 进行检测。粪便样本需在采集后 24 小时内处理,若无法及时处理,则将多个等分样本仅冷冻一次至 - 80°C,避免反复冻融。
- CCNA 和产毒培养按照标准方法操作。CCNA 需对粪便进行离心、过滤,然后将滤液以两种稀释度接种到微孔板的 MRC - 5 细胞上,若出现特征性细胞病变,再用 CD 抗毒素中和进行确认。产毒培养则先对粪便标本进行酒精冲击处理,然后接种到含 5% 马血和 0.1% 牛磺胆酸盐的环丝氨酸 - 头孢西丁 - 果糖琼脂上,培养 48 小时,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(VITEK MS)确认分离株是否为 CD,再用 CCNA 检测 CD 分离株是否产生毒素 B。
- NAAT 使用罗氏 cobas Cdiff Test,按照制造商的说明进行检测。GDH 和毒素 A、B 的检测使用 Vidas GDH 和 Vidas 定性毒素 A 和 B EIA(bioMérieux 公司),同样遵循制造商的操作指南。SIMOA 检测由 bioMérieux 公司完成,根据之前 Banz 等人的研究,SIMOA 毒素 A 和 B 定量 EIA 判定为阳性的阈值分别为 22.1 和 18.8 pg/mL。
- 诊断标准与判定:患者满足以下任一标准即可诊断为 CDI:24 小时内出现至少三次水样至半水样便且无其他明显病因;有毒性巨结肠且 CD 检测呈阳性;慢性腹泻患者在无明显原因的情况下大便特征发生改变且 CD 检测呈阳性;内镜检查显示有假膜性结肠炎;组织病理学检查证实为 CD 结肠炎。由两名认证的传染病医生或护士从业者独立判定患者是否患有 CDI 或定植,他们可获取包括 NAAT 结果在内的所有临床信息,但对 CCNA、定性 CD 毒素 EIA、CD 产毒培养和 SIMOA 毒素 EIA 结果不知情。若出现分歧,则由另一位传染病医生进行裁决。对于每例死亡病例,也由两名医生独立判断 CDI 是否为死因、是否为促成死因或与死因无关,如有分歧,由第三位传染病医生解决。
- 统计分析:构建多变量潜在类别模型,该模型考虑了每个观察测试与其测量指标之间的关联,以及测量指标与 CDI 目标状况之间的关系。测量指标的不同组合形成了四个潜在类别:CD 阴性、CD 定植(细菌存在)、CD 产毒菌株定植(毒素基因存在)和 CDI(毒素存在)。为避免测试准确性估计出现偏差,引入单个随机效应来调整同一受试者多个测试结果之间的依赖性。
采用贝叶斯方法,使用非信息先验分布来估计四个潜在类别的患病率,以及每个测试相对于目标状况和其他测量指标的敏感性和特异性。利用所有可用数据拟合模型,包括部分测试结果缺失的受试者数据,缺失结果通过插补处理。在 R 软件环境中使用 rjags 包进行贝叶斯推断。最后,将 SIMOA 毒素 A 和 B EIA 以及 NAAT 与 CCNA 作为参考方法直接比较,计算它们的敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值。
研究结果
- 患者招募与基线特征:两所研究地点共邀请了 1000 名患者参与研究,其中 292 名患者拒绝,最终 708 名患者纳入研究。这些患者的基线特征显示,平均年龄为 63 岁(标准差 16.3),女性占比 50%,Charlson 合并症指数平均为 3.8(标准差 2.4)。在研究期间,有 4% 的患者有 CDI 病史,7% 的患者在标本采集当天使用过泻药,58% 的患者在采集当天使用过抗生素,70% 的患者在采集前 14 天使用过抗生素。研究期间总死亡率为 7.2%,其中因 CDI 导致的死亡率为 0.1%。
- 检测方法的阳性率:毒素 B 基因 NAAT 的阳性率为 16.2%,CCNA 和产毒培养的阳性率分别为 9.7% 和 15.5%。EIA 方面,VIDAS GDH EIA 阳性率为 21.6%,VIDAS 毒素 A 和 B EIA 阳性率为 7.1%,SIMOA 毒素 A 和 B EIA 阳性率分别为 12.5% 和 11.8%。有 36 例(5%)粪便标本中,SIMOA 毒素 A 或 B EIA 呈阳性,但 CCNA 为阴性。
- 常见检测结果模式与潜在类别概率:研究数据中观察到多种检测结果模式。708 例粪便标本中,69%(488 例)的标本所有诊断测试均为阴性,4.4%(31 例)的标本所有诊断测试均为阳性。还有部分标本呈现出不同的阳性和阴性组合,如 23 例标本 GDH EIA、NAAT 和产毒培养阳性,但 VIDAS 和 SIMOA 毒素 EIA 以及 CCNA 检测毒素为阴性;17 例标本培养分离出 CD 且 GDH EIA 阳性,但其他诊断测试均为阴性。针对每种结果模式,研究人员估计了其属于四个潜在类别的概率,并列出了符合 CDI 临床标准的患者数量。四个潜在类别的估计患病率分别为:CD 阴性 79%(95% 可信区间:0.76 - 0.82);CD 非产毒菌株定植 3%(95% 可信区间:0.02 - 0.05);CD 产毒菌株定植 4%(95% 可信区间:0.02 - 0.06);CDI 14%(95% 可信区间:0.11 - 0.17)。
- 各检测方法的敏感性和特异性:计算各诊断测试针对不同测量指标的敏感性和特异性,并给出 95% 可信区间。结果显示,在检测 CD 细菌方面,VIDAS GDH EIA 敏感性最高,达到 100%(95% 可信区间:0.98 - 1.00);在检测 CD 毒素基因方面,NAAT 敏感性为 90%(95% 可信区间:0.85 - 0.94);在检测 CD 毒素方面,SIMOA 毒素 A 和 B EIA 的敏感性分别为 76%(95% 可信区间:0.66 - 0.83)和 77%(95% 可信区间:0.67 - 0.84),均高于传统 VIDAS 毒素 EIA 的 48%(95% 可信区间:0.41 - 0.55)。在特异性方面,多数检测方法对各自测量指标的特异性都较高,接近或达到 100%。将 SIMOA 毒素 A 和 B EIA 以及 NAAT 与 CCNA 作为参考方法直接比较时,SIMOA 毒素 A EIA 敏感性为 0.84(95% CI:0.73 - 0.92),特异性为 0.95(95% CI:0.93 - 0.97);SIMOA 毒素 B EIA 敏感性为 0.82(95% CI:0.71 - 0.90),特异性为 0.96(95% CI:0.94 - 0.97);NAAT 敏感性为 0.93(95% CI:0.84 - 0.98),特异性为 0.92(95% CI:0.90 - 0.94)。但由于 CDI 患病率较低,NAAT 的阳性预测值较差,SIMOA 毒素 A 和 B EIA 的阳性预测值分别为 0.67(95% CI:0.58 - 0.75)和 0.70(95% CI:0.61 - 0.78)。
讨论
- CD 定植与感染率:研究证实了 CD 定植现象的存在,研究人群中 CDI 的发生率为 14%(95% 可信区间:0.11 - 0.17),无毒素产生的 CD 定植率为 7%(95% 可信区间:0.04 - 0.10),这部分患者腹泻可能由其他原因导致。与现有文献报道的住院患者中 CD - AC 无症状定植率(7% - 18%)相符。
- 检测方法性能分析:NAAT 和产毒培养检测产毒 CD 的敏感性约为 90%,但因其会检测到非产毒的定植菌株,导致对 CDI 检测的特异性和阳性预测值受到影响。本研究中,NAAT 检测产毒菌株的特异性为 99%(包括无症状定植),检测真正 CDI(有毒素产生)的特异性略低,为 95%,与文献报道相近。CCNA 检测 CDI 的特异性接近 100%,但敏感性仅 71%。例如,在 SIMOA 毒素 A 或 B EIA 检测出毒素的 97 例粪便标本中,CCNA 仅 61 例(63%)呈阳性。SIMOA 的敏感性也并非完美,CCNA 检测出毒素的 69 例标本中,SIMOA 毒素 B 检测仅 56 例(81%)呈阳性。传统 CD 毒素 A 和 B EIA 的敏感性较差,仅为 48%(95% 可信区间:0.41 - 0.55),与文献报道一致。而新型 SIMOA 毒素 A 和 B EIA 的敏感性显著高于传统定性 EIA,且优于 CCNA 的估计敏感性,同时保持了接近 100% 的特异性。
- 检测方法局限性与临床意义:研究发现,毒素检测高度依赖实验室方法。本研究模型假设检测到任何量的 CD 毒素都表明存在 CDI,但少量毒素的临床意义尚不明确,可能反映的是定植情况。此外,CD 毒素 EIA 与非 CD 抗原的交叉反应可能导致假阳性和检测结果不一致,从而降低了模型中所有毒素特异性检测的计算敏感性。尽管 NAAT 总体测试特性较好,但由于 CDI 患病率低,其阳性预测值不佳。例如,在 115 例 NAAT 阳性的粪便标本中,仅 64 例(56%)CCNA 呈阳性。在多种检测方法呈阳性但毒素检测均为阴性的情况下,患者患 CDI 的概率为 13%。SIMOA 毒素 A 和 B EIA 虽敏感性优于传统 EIA,甚至可能超过 CCNA,且检测周转时间短、易于标准化,但敏感性仍不足以单独作为检测方法,需与其他更敏感的检测方法(如 NAAT 或 GDH EIA)联合使用。而且,有研究报道 SIMOA 检测的毒素浓度无法区分 CDI 患者和定植者,其对 CDI 的预测能力是否与 CCNA 相当,还需进一步研究。
- 研究模型优势与诊断建议:本研究采用的多变量潜在类别分析模型具有独特优势,与传统的两类模型不同,它能区分每个测试相对于其测量指标和目标状况的准确性。在 CDI 诊断中,不能仅依靠单一的实验室检测方法来区分 CD 定植和 CDI,因为现有检测方法都存在缺陷。临床诊断 CDI 时,需结合临床症状和实验室检查结果进行综合判断,目前仍缺乏高敏感性和高特异性的理想检测方法。
致谢
作者感谢所有参与研究的患者,以及参与研究的各机构的研究助理和技术人员,感谢他们在患者招募、数据收集、标本采集和处理等方面所做的工作。本研究得到了加拿大卫生研究院的支持。