首次解析两种蚕豆染色病毒(BBSV)分离株全基因组序列:探索病毒遗传多样性与进化关系
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时间:2025年04月02日
来源:Archives of Virology 2.5
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为探究蚕豆染色病毒(BBSV)不同菌株的遗传特征,研究人员运用下一代测序(NGS)和 cDNA 末端快速扩增(RACE)技术,测定了突尼斯和叙利亚两菌株的全基因组序列。结果显示两菌株存在差异且与红三叶草斑驳病毒亲缘近,这是首次报道,为深入研究 BBSV 奠定基础。
利用下一代测序(NGS)和 cDNA 末端快速扩增(RACE)技术,测定了两种蚕豆染色病毒(BBSV,属于豇豆花叶病毒属Comovirus)菌株 —— 突尼斯菌株(RNA1,5965 nt;RNA2,3467 nt)和叙利亚菌株(RNA1,5976 nt;RNA2,3449 nt)的完整基因组序列。这两种菌株在 RNA1和 RNA2中的核苷酸序列同一性分别为 79.2% 和 71.6%。预测的蛋白酶 - 聚合酶氨基酸序列同一性为 95.2%,外壳蛋白为 93.9%,表明这些菌株属于豇豆花叶病毒属中的同一物种。系统发育分析表明,这两种菌株都与红三叶草斑驳病毒(属Comovirus)密切相关。这是关于两种 BBSV 菌株完整基因组序列的首次报道。
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