机器学习助力胰腺癌血浆小细胞外囊泡 mRNA 诊断及预后特征开发的关键意义
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时间:2025年04月03日
来源:Digestive Diseases and Sciences 2.5
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胰腺癌(PDAC)因缺乏有效诊断生物标志物常晚期确诊。研究人员分析 100 名参与者血浆小细胞外囊泡(sEVs)的 mRNA 测序数据,构建诊断模型。结果显示,4 sEV mRNAs 诊断特征联合 CA19-9 能区分患者,且该模型分数与预后相关,为 PDAC 诊断和预后评估提供新无创方法。
背景:胰腺癌(Pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)由于缺乏有效的诊断生物标志物,常常在晚期才被确诊。小细胞外囊泡(Small extracellular vesicles,sEVs)作为液体活检中具有潜力的临床生物标志物崭露头角。本研究旨在探索用于 PDAC 诊断的 sEV mRNA 生物标志物,并识别出能够指导 PDAC 患者预后的相关标志物。方法:研究人员分析了 100 名参与者血浆 sEVs 的 mRNA 测序数据,运用四种机器学习技术构建并评估诊断模型。通过四种特征提取方法确定了部分血浆 sEV mRNAs,并用于构建诊断模型。同时,研究人员还评估了该模型对 PDAC 患者生存预后的预测价值。结果:与糖类抗原 19-9(Carbohydrate antigen 19-9,CA19-9)联合使用时,4 sEV mRNAs 诊断特征(d-signature)能够很好地区分 PDAC 患者与非 PDAC 个体、健康对照个体以及胰腺良性疾病患者。在训练队列中,曲线下面积(Area under the curve,AUC)分别为 0.902、0.971 和 0.845;在验证队列中,AUC 分别为 0.803、0.938 和 0.762。此外,Cox 回归分析表明,基于 sEV mRNA 特征构建的分数是 PDAC 生存预后的独立不良预后因素。结论:本研究通过机器学习方法证明了 sEV mRNA d-signature 在 PDAC 诊断中的潜在效用。同时,该诊断模型的分数与 PDAC 患者的不良结局显著相关。这为 PDAC 患者的临床诊断和预后评估提供了一种新的无创 sEV mRNA 特征。
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