烟草 TIFY/JAZ 基因:全基因组视角下的命名、进化与表达研究及其意义
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时间:2025年04月05日
来源:Planta 3.6
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烟草中茉莉酸(JA)信号的 JAZ 调节因子在调控 JA 介导的发育、次生代谢和应激反应中至关重要,但命名混乱。研究人员通过对烟草品种 TN90 进行全基因组分析,鉴定出 32 个 TIFY/JAZ 蛋白,构建了系统命名法,分析了基因转录模式和潜在功能,为相关研究提供了重要信息。
摘要:由于植物特异性的茉莉酸(JA)信号 JAZ 调节因子在调控 JA 介导的发育、次生代谢和应激反应中起着关键作用,烟草中该调节因子受到了广泛研究。JAZs 是 TIFY 蛋白的一个亚家族,然而已报道的烟草属 TIFY/JAZ 调节因子存在命名混乱的问题。本研究通过对烟草品种 TN90 进行全基因组分析,鉴定出 32 个 TIFY/JAZ 蛋白,并获得了它们在野生烟草(Nicotiana sylvestris)和绒毛状烟草(Nicotiana tomentosiformis)中的同源物。通过生物信息学分析,基于系统发育关系将这些 TIFY/JAZ 调节因子分为 4 个亚家族(即 21 个 JAZs、5 个 ZIM 和 ZMLs、2 个 TIFY8s 和 4 个 PPDs),构建了系统命名法,这表明在普通烟草形成过程中存在基因丢失或基因组重排现象。对 JA 诱导表达的分析显示,经 JA 处理后,这些 TIFY/JAZ 基因在叶片和根中呈现出不同的表达模式。进一步的微阵列和代谢组学分析发现,在 JA 激素受体蛋白 COI1功能异常的植株中,5 个 TIFY/JAZ 基因差异表达,一系列初级和次级代谢物的丰度也发生了改变。此外,还构建了烟草 TIFY/JAZ 蛋白的预测蛋白质相互作用网络,结果表明有 120 个蛋白可能与这些调节因子相互作用。本研究结果为烟草中 TIFY/JAZ 蛋白调控 JA 反应和代谢过程提供了有价值的信息,对未来烟草 TIFY/JAZ 蛋白的研究有重要贡献。
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