综述:利用放线菌中未开发的次级代谢途径探索新的天然产物

【字体: 时间:2025年04月05日 来源:Journal of Natural Medicines 2.5

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  这篇综述聚焦放线菌。放线菌能产生多种生物活性次级代谢产物(SMs),但传统方法发现新产物难度增大。文中介绍了利用未开发的次级代谢物生物合成基因簇(SM-BGCs)的研究,包括激活沉默 SM-BGCs 及砷相关次级代谢研究成果,值得关注。

  ### 研究背景
放线菌在生命科学领域有着至关重要的地位,它就像一座天然的 “药物宝库”,能产生多种多样的生物活性次级代谢产物(secondary metabolites,SMs)。这些产物在医药、农业等诸多方面都发挥着关键作用,比如许多抗生素就是由放线菌产生的,为人类对抗疾病立下了汗马功劳。
然而,随着研究的不断深入,利用传统的研究方法去发现新的放线菌来源的天然产物变得越来越困难。就好比在一座已经被反复挖掘的矿山里,想要再找到新的宝藏愈发艰难。与此同时,基因组研究技术的发展,为我们开启了一扇新的大门。通过对放线菌进行基因组研究发现,在放线菌的基因中,存在着大量尚未被开发利用的次级代谢产物生物合成基因簇(secondary metabolite biosynthetic gene clusters,SM-BGCs) ,这意味着放线菌还有巨大的潜力等待我们去挖掘。如果能够利用好这些未开发的次级代谢途径,就有可能发现更多新的放线菌来源的天然产物,为生命科学和健康医学领域带来新的突破。

利用共培养激活沉默 SM-BGCs


研究人员将目光聚焦到了放线菌中沉默的 SM-BGCs 上。这些沉默的基因簇就像是被锁住的宝藏,蕴含着产生新天然产物的潜力,但一直处于沉睡状态。为了唤醒它们,研究人员采用了一种独特的方法 —— 共培养。

研究人员选择将各种放线菌与含分枝菌酸细菌(mycolic acid-containing bacteria,MACB)进行共培养。在这个过程中,就像是为沉默的基因簇找到了一把特殊的 “钥匙”。经过一系列的实验和分析,这种共培养的方法取得了令人惊喜的成果。研究人员成功鉴定出了 20 种放线菌次级代谢产物,其中有 16 种是全新的化合物。这一发现为探索新的天然产物开辟了一条新的道路,也让人们看到了共培养方法在激活沉默基因簇方面的巨大潜力。

砷相关次级代谢研究


在对放线菌的研究中,砷相关的次级代谢一直是一个容易被忽视的领域,尤其是在模式放线菌中。但研究人员并没有放过这个看似不起眼的角落,他们深入探索,取得了一系列重要的发现。

研究人员发现了一种全新的有机砷天然产物,这一发现就像在黑暗中找到了一颗璀璨的星星。而且,研究人员还进一步深入研究了这种天然产物的生物合成策略。令人惊讶的是,它的生物合成过程竟然不依赖于 S - 腺苷蛋氨酸(S-adenosylmethionine,SAM) 依赖的酶。这种独特的生物合成策略打破了以往人们对生物合成途径的认知,为研究生物体内的代谢过程提供了新的视角,也为后续开发利用这种有机砷天然产物奠定了理论基础。

研究意义与展望


这项关于利用放线菌中未开发的次级代谢途径探索新天然产物的研究,具有多方面的重要意义。在生命科学理论研究方面,它丰富了我们对放线菌次级代谢过程的认识,让我们对放线菌这个小小的 “微生物工厂” 有了更深入的了解。通过揭示沉默 SM-BGCs 的激活机制以及砷相关次级代谢的独特过程,为进一步研究微生物的代谢调控提供了宝贵的线索。

在健康医学领域,新发现的天然产物可能具有潜在的药用价值。这些新化合物说不定能成为未来新型药物的重要来源,帮助人类对抗各种疾病。比如,新发现的有机砷天然产物,也许在抗癌、抗菌等方面有着独特的功效,虽然目前还需要更多的研究去验证,但已经展现出了令人期待的前景。

从未来的研究方向来看,基于现有的研究成果,可以进一步扩大共培养实验的范围,尝试将不同种类的放线菌与更多类型的微生物进行共培养,说不定能发现更多新的激活沉默基因簇的方法,从而获得更多新颖的天然产物。对于砷相关的次级代谢研究,可以深入探究这种独特的生物合成策略在其他微生物中的存在情况,以及能否利用这种策略开发新的生物合成技术,用于生产更多有价值的化合物。

总之,这项研究为我们打开了一扇通往新天然产物世界的大门,虽然前方还有许多未知等待我们去探索,但每一步的研究进展都可能为生命科学和健康医学领域带来巨大的变革。
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