多重耐药鲍曼不动杆菌临床与定植菌株多位点序列分型及全球菌株对比研究

编辑推荐：本研究针对医院感染重要病原体鲍曼不动杆菌(A. baumannii)的耐药传播问题，通过Pasteur方案的MLST技术对181株MDR/XDR菌株进行分型，发现ST149(72株)和ST2(62株)为优势克隆，鉴定23个新ST型，揭示国际克隆2(ST2)通过SLV/DLV变异产生2125等新型耐药株的进化特征，为院内感染防控提供分子流行病学依据。

　　 鲍曼不动杆菌作为"ESKAPE"耐药病原体成员，已成为全球医院感染防控的重大挑战。该菌在亚洲地区的感染率是西方国家的两倍，且随着碳青霉烯类抗生素的滥用，多重耐药(MDR)和广泛耐药(XDR)菌株不断涌现。更棘手的是，这种病原体不仅存在于临床样本中，还能在医疗环境表面长期存活，并通过医护人员和医疗器械传播。目前对印度地区鲍曼不动杆菌的分子流行病学特征及其与国际流行株的关联仍缺乏系统研究，这严重制约了精准防控策略的制定。

为解决这一问题，来自呼吸疾病研究所的Jyoti Choudhary和Malini Shariff*团队对2018-2021年间收集的181株鲍曼不动杆菌（包括157株临床分离株、20株定植株和4株环境株）进行了系统的多位点序列分型(MLST)研究。所有菌株均通过MALDI-TOF MS和bla_OXA-51 PCR验证，并采用Pasteur分型方案对cpn60、fusA等7个管家基因进行扩增测序。研究通过PUBMLST数据库进行等位基因匹配，并运用eBURST算法构建克隆复合体，最终将成果发表在《BMC Microbiology》。

关键技术方法包括：1)采用Pasteur-MLST方案对7个管家基因进行PCR扩增和测序；2)通过PUBMLST数据库进行序列型(ST)鉴定；3)使用eBURST v3进行克隆复合体分析和SLV/DLV变异检测；4)结合CLSI 2020标准开展药敏试验，包括微量肉汤稀释法测定多粘菌素MIC。

研究结果揭示：

1. 分子分型特征：在181株菌株中共鉴定出23个新ST型，其中ST2125（ST2的SLV变体）以12株成为最常见新亚型。已知ST型中ST149(72株)和ST2(62株)占主导，后者携带bla_OXA-23碳青霉烯酶基因。

2. 克隆进化分析：eBURST将菌株分为三大克隆群——以ST2为核心的Group I(86株)和以ST149为核心的Group III(79株)。值得注意的是，ST2通过单/双位点变异(SLV/DLV)产生了415、2125等5个亚型，显示活跃的本地进化。

3. 全球对比研究：与国际数据库比对发现，印度菌株ST149可能源自2005年日本分离株，经尼泊尔传播而来；而ST2作为国际克隆2的代表，在全球1152株呼吸道分离株中占比最高(396株)，证实其跨洲传播能力。

4. 耐药-分型关联：所有ST2菌株均携带bla_OXA-23，且临床株与定植株的ST分布无差异，提示院内交叉传播风险。4株XDR菌株分属不同ST型，表明耐药性进化存在多克隆起源。

讨论与结论： 本研究首次系统描绘了印度呼吸道感染相关鲍曼不动杆菌的分子流行病学图谱。主要发现包括：1)ST149成为本地优势克隆，可能通过国际旅行传播；2)ST2通过基因微进化产生2125等新型耐药亚株，这些变异株目前尚未扩散至其他地区；3)环境分离株与临床株共享相同ST型，证实医院环境作为耐药菌储库的重要性。

该研究的临床意义在于：为院内感染暴发调查提供分子分型参考标准；揭示国际克隆2通过局部变异持续进化的动态过程；强调需加强医疗环境消毒和抗生素管理来遏制耐药克隆传播。未来研究应结合全基因组测序(WGS)深入解析耐药基因传播机制，为开发快速分子诊断工具奠定基础。