非编码 RNA(miRNA、circRNA、lncRNA)与基因互作调控白癜风机制的探索及潜在诊疗靶点挖掘
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时间:2025年04月06日
来源:Archives of Dermatological Research 1.8
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为探究白癜风发病机制中 miRNAs、circRNAs 和 lncRNAs 的作用及其与关键基因、通路的互作关系,研究人员利用 GEO 数据库数据展开研究。结果确定 2 个基因、2 个 miRNAs 和 5 个 circRNAs 或可作潜在生物标志物及治疗靶点,有助于推动白癜风诊疗研究。
白癜风是一种慢性皮肤病,其特征是黑素细胞缺失,导致皮肤出现色素脱失斑。目前,白癜风的分子机制尚未完全明确,近期研究强调了非编码 RNA 在疾病发病机制中的作用。为了识别和分析微小 RNA(miRNA)、环状 RNA(circRNA)和长链非编码 RNA(lncRNA)在白癜风发病机制中的作用,重点研究它们与关键编码基因和通路的相互作用。研究人员利用基因表达综合数据库(GEO)中 GSE65127 和 GSE75819 数据集的微阵列数据,来识别与白癜风相关的差异表达基因(DEG)。通过 GEO2R 进行分析,以确定上调和下调的基因。利用 STRING 构建蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)网络,并借助 Cytoscape 和 CytoHubba 进一步分析。基因本体论(GO)、疾病通路、疾病基因关联和表型由多种在线软件确定。利用生物信息学工具预测 miRNA、circRNA 和 lncRNA。构建的网络确定 AKT1 为中心枢纽,hsa - miR - 140 - 3p 通过与 AKT1 和组织蛋白酶 D(CTSD)相互作用发挥关键作用,而像 hsa_circ_0020776、hsa_circ_0033552 和 hsa_circ_0020773 等 circRNA 显著调节这些相互作用。此外,hsa - miR - 921 与 AKT1 以及 hsa_circ_0033546 和 hsa_circ_0033547 具有高效结合能力。包括 AFAP1 - AS1 和转移相关肺腺癌转录本 1(MALAT1)在内的 lncRNA,通过与靶基因的 mRNA 建立连接,为该网络做出贡献。研究确定了 2 个基因、2 个 miRNA 和 5 个 circRNA 可能作为白癜风的潜在生物标志物或治疗靶点。
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