揭示观赏帆鳍花鳉(Poecilia velifera)在印尼非本土水域的线粒体基因组特征及系统发育奥秘
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时间:2025年04月06日
来源:Biochemical Genetics 2.1
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为探究观赏帆鳍花鳉(Poecilia velifera)完整线粒体基因组结构及其变异,研究人员对印尼万丹省非本土咸水生态系统中的该物种进行研究。测得其线粒体基因组长度为 16,627 bp,明确了基因组成。研究有助于物种鉴定、理解种群结构,强调检疫法规对保护本土鱼类的重要性。
观赏鱼帆鳍花鳉(Poecilia velifera,花鳉科)已从其原产于墨西哥尤卡坦半岛的栖息地,广泛扩散到世界各地的非本土生态系统中。尽管已有部分线粒体和核基因信息,但该物种完整的线粒体基因组结构及其变异情况仍不明确,而这对于全面的基因特征描述和详细的系统发育研究至关重要。本研究运用下一代测序技术,对在印尼万丹省非本土咸水生态系统中经形态学鉴定的帆鳍花鳉进行线粒体基因组从头测序。所得线粒体基因组长度为 16,627 bp,包含 13 个蛋白质编码基因(PCGs)、22 个转运 RNA、2 个核糖体 RNA 以及 1 个非编码控制区(CR)。这一结果加深了我们对帆鳍花鳉相较于其同属物种基因组成的理解。此外,在 CR 区域保守模块中鉴定出的核苷酸变异,有助于深入了解这一非编码区域的功能。基于串联 PCGs 的贝叶斯系统发育推断,成功区分了帆鳍花鳉与其同属物种,并显示花鳉属(Poecilia)在花鳉科中形成单系聚类,这与早期进化假设相符。这首个帆鳍花鳉线粒体基因组,为未来利用多种线粒体标记进行物种鉴定和了解种群结构奠定了基础。此外,通过研究该观赏物种在非本土生态系统中的遗传证据,本研究强调了严格检疫法规对保护印尼本土鱼类物种的重要性。
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