化疗诱导的周围神经病变（CIPN）的药物基因组学：基于电子健康记录定义的全基因组关联研究 —— 探索潜在基因位点及研究新方向

《Supportive Care in Cancer》：Pharmacogenomics of chemotherapy induced peripheral neuropathy using an electronic health record-derived definition: a genome-wide association study

此前评估化疗诱导周围神经病变（CIPN）遗传易感性的研究受限于样本量小，因现实数据提取困难。来自科罗拉多个性化医学中心的研究人员开展了一项全基因组关联研究（GWAS），发现多个可能调节 CIPN 发展的基因组位点，为后续研究提供了方向。

　　目的：先前评估化疗诱导的周围神经病变（CIPN）遗传易感性的研究，由于难以获取真实世界数据，样本量较小。本全基因组关联研究（GWAS）利用电子健康记录（EHR）对 CIPN 的定义，评估发生 CIPN 的患者与未受影响患者之间的基因差异。方法：本研究纳入所有接受与 CIPN 相关化疗且在科罗拉多个性化医学中心生物样本库中有生殖系遗传数据的患者。CIPN 的定义为在特定化疗开始后，新开神经病理性疼痛药物或有神经病变的国际疾病分类（ICD）诊断。GWAS 按（1）总人群、（2）铂类化疗、（3）紫杉烷类化疗和（4）长春花生物碱化疗进行分层。在每个 GWAS 中分析先前与 CIPN 相关的基因。结果：915 名患者接受了与 CIPN 相关的化疗，其中 528 名患者（57%）发生了 CIPN。化疗开始时的中位年龄为 60.5 岁；女性（n = 517，56.5%）和白种人（n = 822，89.8%）最为常见。在达到全基因组显著提示水平（p < 1×10^?5）的单核苷酸多态性（SNPs）中，60 个 SNPs 出现在 11 个可能在 CIPN 的发生或预防中起作用的基因内，包括 RCOR1、CLDN14、TRIM5 和 TMC2。在这一人群中，先前与 CIPN 相关的 SNPs 均未达到全基因组显著性。结论：这项药物基因组学研究表明，有几个基因组位点可能调节 CIPN 的发展。这种基于 EHR 的定义可能有助于在未来 CIPN 的遗传研究中增加样本量并提高统计效力。